Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4M9

EHD1, EH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD1Q9H4M9 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EHD1Q9H4M9 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EHD1Q9H4M9 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EHD1Q9H4M9 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EHD1Q9H4M9 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EHD1Q9H4M9 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EHD1Q9H4M9 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EHD1Q9H4M9 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
EHD1Q9H4M9 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
EHD1Q9H4M9 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
EHD1Q9H4M9 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
EHD1Q9H4M9 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EHD1Q9H4M9 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EHD1Q9H4M9 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EHD1Q9H4M9 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EHD1Q9H4M9 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EHD1Q9H4M9 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EHD1Q9H4M9 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EHD1Q9H4M9 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EHD1Q9H4M9 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EHD1Q9H4M9 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EHD1Q9H4M9 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EHD1Q9H4M9 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EHD1Q9H4M9 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EHD1Q9H4M9 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EHD1Q9H4M9 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EHD1Q9H4M9 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EHD1Q9H4M9 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EHD1Q9H4M9 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EHD1Q9H4M9 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EHD1Q9H4M9 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EHD1Q9H4M9 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EHD1Q9H4M9 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EHD1Q9H4M9 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EHD1Q9H4M9 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EHD1Q9H4M9 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EHD1Q9H4M9 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EHD1Q9H4M9 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EHD1Q9H4M9 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EHD1Q9H4M9 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EHD1Q9H4M9 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EHD1Q9H4M9 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EHD1Q9H4M9 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EHD1Q9H4M9 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EHD1Q9H4M9 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
EHD1Q9H4M9 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EHD1Q9H4M9 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EHD1Q9H4M9 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
EHD1Q9H4M9 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EHD1Q9H4M9 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EHD1Q9H4M9 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EHD1Q9H4M9 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EHD1Q9H4M9 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EHD1Q9H4M9 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EHD1Q9H4M9 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EHD1Q9H4M9 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EHD1Q9H4M9 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EHD1Q9H4M9 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EHD1Q9H4M9 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EHD1Q9H4M9 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EHD1Q9H4M9 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EHD1Q9H4M9 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EHD1Q9H4M9 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EHD1Q9H4M9 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EHD1Q9H4M9 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EHD1Q9H4M9 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EHD1Q9H4M9 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EHD1Q9H4M9 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EHD1Q9H4M9 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EHD1Q9H4M9 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
EHD1Q9H4M9 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EHD1Q9H4M9 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EHD1Q9H4M9 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EHD1Q9H4M9 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EHD1Q9H4M9 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EHD1Q9H4M9 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EHD1Q9H4M9 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
EHD1Q9H4M9 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EHD1Q9H4M9 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EHD1Q9H4M9 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EHD1Q9H4M9 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EHD1Q9H4M9 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EHD1Q9H4M9 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EHD1Q9H4M9 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EHD1Q9H4M9 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EHD1Q9H4M9 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EHD1Q9H4M9 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EHD1Q9H4M9 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EHD1Q9H4M9 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EHD1Q9H4M9 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EHD1Q9H4M9 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EHD1Q9H4M9 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EHD1Q9H4M9 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EHD1Q9H4M9 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EHD1Q9H4M9 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
EHD1Q9H4M9 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EHD1Q9H4M9 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EHD1Q9H4M9 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EHD1Q9H4M9 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EHD1Q9H4M9 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms