Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4K1

RIBC2, RIB43A-like with coiled-coils protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIBC2Q9H4K1 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RIBC2Q9H4K1 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RIBC2Q9H4K1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RIBC2Q9H4K1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RIBC2Q9H4K1 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RIBC2Q9H4K1 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RIBC2Q9H4K1 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
RIBC2Q9H4K1 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RIBC2Q9H4K1 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RIBC2Q9H4K1 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RIBC2Q9H4K1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RIBC2Q9H4K1 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RIBC2Q9H4K1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RIBC2Q9H4K1 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RIBC2Q9H4K1 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RIBC2Q9H4K1 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RIBC2Q9H4K1 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RIBC2Q9H4K1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RIBC2Q9H4K1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RIBC2Q9H4K1 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RIBC2Q9H4K1 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RIBC2Q9H4K1 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RIBC2Q9H4K1 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RIBC2Q9H4K1 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RIBC2Q9H4K1 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RIBC2Q9H4K1 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RIBC2Q9H4K1 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RIBC2Q9H4K1 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RIBC2Q9H4K1 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RIBC2Q9H4K1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RIBC2Q9H4K1 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RIBC2Q9H4K1 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RIBC2Q9H4K1 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RIBC2Q9H4K1 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
RIBC2Q9H4K1 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RIBC2Q9H4K1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RIBC2Q9H4K1 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RIBC2Q9H4K1 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RIBC2Q9H4K1 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RIBC2Q9H4K1 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RIBC2Q9H4K1 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RIBC2Q9H4K1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RIBC2Q9H4K1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RIBC2Q9H4K1 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RIBC2Q9H4K1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RIBC2Q9H4K1 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RIBC2Q9H4K1 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RIBC2Q9H4K1 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RIBC2Q9H4K1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RIBC2Q9H4K1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RIBC2Q9H4K1 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RIBC2Q9H4K1 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RIBC2Q9H4K1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RIBC2Q9H4K1 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RIBC2Q9H4K1 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RIBC2Q9H4K1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RIBC2Q9H4K1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RIBC2Q9H4K1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RIBC2Q9H4K1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RIBC2Q9H4K1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RIBC2Q9H4K1 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RIBC2Q9H4K1 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RIBC2Q9H4K1 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RIBC2Q9H4K1 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RIBC2Q9H4K1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RIBC2Q9H4K1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RIBC2Q9H4K1 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RIBC2Q9H4K1 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RIBC2Q9H4K1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RIBC2Q9H4K1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RIBC2Q9H4K1 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RIBC2Q9H4K1 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RIBC2Q9H4K1 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RIBC2Q9H4K1 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RIBC2Q9H4K1 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RIBC2Q9H4K1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RIBC2Q9H4K1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RIBC2Q9H4K1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
RIBC2Q9H4K1 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RIBC2Q9H4K1 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RIBC2Q9H4K1 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RIBC2Q9H4K1 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RIBC2Q9H4K1 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RIBC2Q9H4K1 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RIBC2Q9H4K1 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RIBC2Q9H4K1 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RIBC2Q9H4K1 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RIBC2Q9H4K1 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
RIBC2Q9H4K1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RIBC2Q9H4K1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RIBC2Q9H4K1 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RIBC2Q9H4K1 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RIBC2Q9H4K1 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RIBC2Q9H4K1 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RIBC2Q9H4K1 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RIBC2Q9H4K1 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RIBC2Q9H4K1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RIBC2Q9H4K1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
RIBC2Q9H4K1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RIBC2Q9H4K1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms