Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2S5

RNF39, RING finger protein 39, humanhuman

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Length 420 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF39Q9H2S5 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RNF39Q9H2S5 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RNF39Q9H2S5 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RNF39Q9H2S5 AC091489.1-201ENST00000563866 691 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RNF39Q9H2S5 LRTM1-201ENST00000273286 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RNF39Q9H2S5 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RNF39Q9H2S5 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RNF39Q9H2S5 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RNF39Q9H2S5 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RNF39Q9H2S5 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RNF39Q9H2S5 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RNF39Q9H2S5 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RNF39Q9H2S5 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RNF39Q9H2S5 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RNF39Q9H2S5 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RNF39Q9H2S5 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RNF39Q9H2S5 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RNF39Q9H2S5 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF39Q9H2S5 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF39Q9H2S5 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF39Q9H2S5 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF39Q9H2S5 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF39Q9H2S5 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF39Q9H2S5 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF39Q9H2S5 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF39Q9H2S5 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF39Q9H2S5 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF39Q9H2S5 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNF39Q9H2S5 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNF39Q9H2S5 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNF39Q9H2S5 TMEM108-AS1-201ENST00000504993 705 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNF39Q9H2S5 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNF39Q9H2S5 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNF39Q9H2S5 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RNF39Q9H2S5 AL078595.1-201ENST00000404458 226 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
RNF39Q9H2S5 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RNF39Q9H2S5 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RNF39Q9H2S5 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RNF39Q9H2S5 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RNF39Q9H2S5 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RNF39Q9H2S5 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RNF39Q9H2S5 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RNF39Q9H2S5 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
RNF39Q9H2S5 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RNF39Q9H2S5 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RNF39Q9H2S5 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RNF39Q9H2S5 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RNF39Q9H2S5 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RNF39Q9H2S5 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RNF39Q9H2S5 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
RNF39Q9H2S5 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
RNF39Q9H2S5 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RNF39Q9H2S5 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
RNF39Q9H2S5 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RNF39Q9H2S5 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RNF39Q9H2S5 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RNF39Q9H2S5 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RNF39Q9H2S5 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RNF39Q9H2S5 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RNF39Q9H2S5 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RNF39Q9H2S5 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RNF39Q9H2S5 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RNF39Q9H2S5 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RNF39Q9H2S5 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RNF39Q9H2S5 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RNF39Q9H2S5 LINC01431-201ENST00000442440 514 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RNF39Q9H2S5 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RNF39Q9H2S5 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RNF39Q9H2S5 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RNF39Q9H2S5 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RNF39Q9H2S5 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RNF39Q9H2S5 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RNF39Q9H2S5 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RNF39Q9H2S5 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
RNF39Q9H2S5 AC016180.1-201ENST00000567945 403 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
RNF39Q9H2S5 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
RNF39Q9H2S5 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
RNF39Q9H2S5 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RNF39Q9H2S5 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RNF39Q9H2S5 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RNF39Q9H2S5 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RNF39Q9H2S5 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RNF39Q9H2S5 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
RNF39Q9H2S5 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RNF39Q9H2S5 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RNF39Q9H2S5 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RNF39Q9H2S5 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RNF39Q9H2S5 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RNF39Q9H2S5 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RNF39Q9H2S5 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RNF39Q9H2S5 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RNF39Q9H2S5 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RNF39Q9H2S5 AC006518.1-201ENST00000541449 943 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
RNF39Q9H2S5 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RNF39Q9H2S5 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RNF39Q9H2S5 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RNF39Q9H2S5 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RNF39Q9H2S5 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RNF39Q9H2S5 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RNF39Q9H2S5 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
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