Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU5

NYX, Nyctalopin, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NYXQ9GZU5 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NYXQ9GZU5 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NYXQ9GZU5 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NYXQ9GZU5 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NYXQ9GZU5 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NYXQ9GZU5 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC29.01■■■□□ 2.23
NYXQ9GZU5 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
NYXQ9GZU5 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
NYXQ9GZU5 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
NYXQ9GZU5 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NYXQ9GZU5 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NYXQ9GZU5 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NYXQ9GZU5 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
NYXQ9GZU5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
NYXQ9GZU5 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
NYXQ9GZU5 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
NYXQ9GZU5 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
NYXQ9GZU5 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
NYXQ9GZU5 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC29■■■□□ 2.23
NYXQ9GZU5 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NYXQ9GZU5 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NYXQ9GZU5 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NYXQ9GZU5 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NYXQ9GZU5 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NYXQ9GZU5 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NYXQ9GZU5 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NYXQ9GZU5 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NYXQ9GZU5 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NYXQ9GZU5 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
NYXQ9GZU5 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NYXQ9GZU5 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NYXQ9GZU5 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NYXQ9GZU5 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
NYXQ9GZU5 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NYXQ9GZU5 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NYXQ9GZU5 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NYXQ9GZU5 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NYXQ9GZU5 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NYXQ9GZU5 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NYXQ9GZU5 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NYXQ9GZU5 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
NYXQ9GZU5 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NYXQ9GZU5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NYXQ9GZU5 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NYXQ9GZU5 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NYXQ9GZU5 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
NYXQ9GZU5 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NYXQ9GZU5 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NYXQ9GZU5 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
NYXQ9GZU5 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NYXQ9GZU5 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NYXQ9GZU5 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NYXQ9GZU5 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NYXQ9GZU5 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NYXQ9GZU5 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NYXQ9GZU5 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
NYXQ9GZU5 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NYXQ9GZU5 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NYXQ9GZU5 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NYXQ9GZU5 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NYXQ9GZU5 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
NYXQ9GZU5 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
NYXQ9GZU5 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
NYXQ9GZU5 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
NYXQ9GZU5 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
NYXQ9GZU5 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NYXQ9GZU5 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
NYXQ9GZU5 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NYXQ9GZU5 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
NYXQ9GZU5 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NYXQ9GZU5 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NYXQ9GZU5 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
NYXQ9GZU5 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NYXQ9GZU5 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NYXQ9GZU5 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NYXQ9GZU5 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NYXQ9GZU5 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NYXQ9GZU5 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NYXQ9GZU5 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NYXQ9GZU5 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NYXQ9GZU5 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NYXQ9GZU5 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NYXQ9GZU5 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NYXQ9GZU5 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NYXQ9GZU5 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NYXQ9GZU5 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NYXQ9GZU5 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NYXQ9GZU5 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NYXQ9GZU5 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NYXQ9GZU5 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
NYXQ9GZU5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NYXQ9GZU5 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NYXQ9GZU5 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NYXQ9GZU5 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NYXQ9GZU5 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
NYXQ9GZU5 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
NYXQ9GZU5 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NYXQ9GZU5 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NYXQ9GZU5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NYXQ9GZU5 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms