Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM8

NDEL1, Nuclear distribution protein nudE-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDEL1Q9GZM8 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NDEL1Q9GZM8 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NDEL1Q9GZM8 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
NDEL1Q9GZM8 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NDEL1Q9GZM8 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NDEL1Q9GZM8 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NDEL1Q9GZM8 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NDEL1Q9GZM8 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NDEL1Q9GZM8 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NDEL1Q9GZM8 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NDEL1Q9GZM8 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NDEL1Q9GZM8 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NDEL1Q9GZM8 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
NDEL1Q9GZM8 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
NDEL1Q9GZM8 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NDEL1Q9GZM8 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
NDEL1Q9GZM8 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NDEL1Q9GZM8 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NDEL1Q9GZM8 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NDEL1Q9GZM8 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NDEL1Q9GZM8 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NDEL1Q9GZM8 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NDEL1Q9GZM8 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NDEL1Q9GZM8 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NDEL1Q9GZM8 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NDEL1Q9GZM8 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NDEL1Q9GZM8 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NDEL1Q9GZM8 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NDEL1Q9GZM8 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NDEL1Q9GZM8 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NDEL1Q9GZM8 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NDEL1Q9GZM8 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
NDEL1Q9GZM8 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NDEL1Q9GZM8 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NDEL1Q9GZM8 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NDEL1Q9GZM8 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NDEL1Q9GZM8 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NDEL1Q9GZM8 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
NDEL1Q9GZM8 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NDEL1Q9GZM8 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NDEL1Q9GZM8 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NDEL1Q9GZM8 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NDEL1Q9GZM8 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NDEL1Q9GZM8 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NDEL1Q9GZM8 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NDEL1Q9GZM8 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NDEL1Q9GZM8 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NDEL1Q9GZM8 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NDEL1Q9GZM8 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NDEL1Q9GZM8 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
NDEL1Q9GZM8 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NDEL1Q9GZM8 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NDEL1Q9GZM8 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NDEL1Q9GZM8 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NDEL1Q9GZM8 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NDEL1Q9GZM8 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NDEL1Q9GZM8 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NDEL1Q9GZM8 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NDEL1Q9GZM8 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NDEL1Q9GZM8 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
NDEL1Q9GZM8 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NDEL1Q9GZM8 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
NDEL1Q9GZM8 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NDEL1Q9GZM8 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NDEL1Q9GZM8 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NDEL1Q9GZM8 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NDEL1Q9GZM8 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NDEL1Q9GZM8 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NDEL1Q9GZM8 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NDEL1Q9GZM8 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NDEL1Q9GZM8 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NDEL1Q9GZM8 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NDEL1Q9GZM8 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NDEL1Q9GZM8 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NDEL1Q9GZM8 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NDEL1Q9GZM8 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NDEL1Q9GZM8 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NDEL1Q9GZM8 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NDEL1Q9GZM8 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NDEL1Q9GZM8 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NDEL1Q9GZM8 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NDEL1Q9GZM8 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NDEL1Q9GZM8 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NDEL1Q9GZM8 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NDEL1Q9GZM8 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NDEL1Q9GZM8 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NDEL1Q9GZM8 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NDEL1Q9GZM8 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NDEL1Q9GZM8 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NDEL1Q9GZM8 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NDEL1Q9GZM8 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NDEL1Q9GZM8 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NDEL1Q9GZM8 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NDEL1Q9GZM8 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NDEL1Q9GZM8 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NDEL1Q9GZM8 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NDEL1Q9GZM8 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NDEL1Q9GZM8 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NDEL1Q9GZM8 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NDEL1Q9GZM8 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms