Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I9

LRRC27, Leucine-rich repeat-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC27Q9C0I9 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
LRRC27Q9C0I9 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRRC27Q9C0I9 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRRC27Q9C0I9 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRRC27Q9C0I9 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRRC27Q9C0I9 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRRC27Q9C0I9 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRRC27Q9C0I9 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRRC27Q9C0I9 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRRC27Q9C0I9 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRRC27Q9C0I9 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRRC27Q9C0I9 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRC27Q9C0I9 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRC27Q9C0I9 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRC27Q9C0I9 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRC27Q9C0I9 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRC27Q9C0I9 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRC27Q9C0I9 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRC27Q9C0I9 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRC27Q9C0I9 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRC27Q9C0I9 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRC27Q9C0I9 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRC27Q9C0I9 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRC27Q9C0I9 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRC27Q9C0I9 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRC27Q9C0I9 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
LRRC27Q9C0I9 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRRC27Q9C0I9 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRRC27Q9C0I9 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRRC27Q9C0I9 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRRC27Q9C0I9 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRRC27Q9C0I9 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRRC27Q9C0I9 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRRC27Q9C0I9 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRC27Q9C0I9 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRC27Q9C0I9 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRC27Q9C0I9 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRC27Q9C0I9 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRC27Q9C0I9 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRC27Q9C0I9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRC27Q9C0I9 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRC27Q9C0I9 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRC27Q9C0I9 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRC27Q9C0I9 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRC27Q9C0I9 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRC27Q9C0I9 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRC27Q9C0I9 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRC27Q9C0I9 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
LRRC27Q9C0I9 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
LRRC27Q9C0I9 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRRC27Q9C0I9 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRRC27Q9C0I9 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRRC27Q9C0I9 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRRC27Q9C0I9 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRRC27Q9C0I9 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRRC27Q9C0I9 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRRC27Q9C0I9 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRRC27Q9C0I9 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRRC27Q9C0I9 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
LRRC27Q9C0I9 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRRC27Q9C0I9 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRRC27Q9C0I9 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRRC27Q9C0I9 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRRC27Q9C0I9 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRRC27Q9C0I9 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRRC27Q9C0I9 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRRC27Q9C0I9 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
LRRC27Q9C0I9 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRRC27Q9C0I9 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRRC27Q9C0I9 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRRC27Q9C0I9 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRRC27Q9C0I9 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRRC27Q9C0I9 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRRC27Q9C0I9 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRRC27Q9C0I9 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRRC27Q9C0I9 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRRC27Q9C0I9 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRRC27Q9C0I9 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRRC27Q9C0I9 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRRC27Q9C0I9 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRRC27Q9C0I9 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRRC27Q9C0I9 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRRC27Q9C0I9 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRRC27Q9C0I9 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRRC27Q9C0I9 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRRC27Q9C0I9 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRRC27Q9C0I9 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRRC27Q9C0I9 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRRC27Q9C0I9 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRRC27Q9C0I9 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRRC27Q9C0I9 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRRC27Q9C0I9 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LRRC27Q9C0I9 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LRRC27Q9C0I9 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LRRC27Q9C0I9 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LRRC27Q9C0I9 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LRRC27Q9C0I9 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
LRRC27Q9C0I9 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
LRRC27Q9C0I9 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
LRRC27Q9C0I9 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.7 ms