Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
PCGF6Q9BYE7 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
PCGF6Q9BYE7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
PCGF6Q9BYE7 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
PCGF6Q9BYE7 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC35.77■■■■□ 3.32
PCGF6Q9BYE7 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
PCGF6Q9BYE7 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
PCGF6Q9BYE7 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.77■■■■□ 3.32
PCGF6Q9BYE7 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
PCGF6Q9BYE7 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.32
PCGF6Q9BYE7 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.32
PCGF6Q9BYE7 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC35.76■■■■□ 3.32
PCGF6Q9BYE7 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
PCGF6Q9BYE7 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
PCGF6Q9BYE7 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
PCGF6Q9BYE7 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
PCGF6Q9BYE7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
PCGF6Q9BYE7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
PCGF6Q9BYE7 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
PCGF6Q9BYE7 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
PCGF6Q9BYE7 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
PCGF6Q9BYE7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
PCGF6Q9BYE7 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
PCGF6Q9BYE7 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC35.75■■■■□ 3.31
PCGF6Q9BYE7 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
PCGF6Q9BYE7 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
PCGF6Q9BYE7 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
PCGF6Q9BYE7 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
PCGF6Q9BYE7 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
PCGF6Q9BYE7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.74■■■■□ 3.31
PCGF6Q9BYE7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
PCGF6Q9BYE7 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.74■■■■□ 3.31
PCGF6Q9BYE7 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
PCGF6Q9BYE7 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
PCGF6Q9BYE7 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
PCGF6Q9BYE7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
PCGF6Q9BYE7 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
PCGF6Q9BYE7 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
PCGF6Q9BYE7 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
PCGF6Q9BYE7 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC35.73■■■■□ 3.31
PCGF6Q9BYE7 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
PCGF6Q9BYE7 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
PCGF6Q9BYE7 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
PCGF6Q9BYE7 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
PCGF6Q9BYE7 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
PCGF6Q9BYE7 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
PCGF6Q9BYE7 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
PCGF6Q9BYE7 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
PCGF6Q9BYE7 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
PCGF6Q9BYE7 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
PCGF6Q9BYE7 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
PCGF6Q9BYE7 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
PCGF6Q9BYE7 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
PCGF6Q9BYE7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.71■■■■□ 3.31
PCGF6Q9BYE7 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
PCGF6Q9BYE7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
PCGF6Q9BYE7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC35.7■■■■□ 3.31
PCGF6Q9BYE7 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
PCGF6Q9BYE7 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
PCGF6Q9BYE7 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
PCGF6Q9BYE7 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC35.69■■■■□ 3.3
PCGF6Q9BYE7 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC35.68■■■■□ 3.3
PCGF6Q9BYE7 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
PCGF6Q9BYE7 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC35.68■■■■□ 3.3
PCGF6Q9BYE7 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
PCGF6Q9BYE7 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
PCGF6Q9BYE7 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
PCGF6Q9BYE7 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
PCGF6Q9BYE7 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
PCGF6Q9BYE7 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
PCGF6Q9BYE7 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
PCGF6Q9BYE7 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
PCGF6Q9BYE7 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
PCGF6Q9BYE7 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC35.67■■■■□ 3.3
PCGF6Q9BYE7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
PCGF6Q9BYE7 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC35.66■■■■□ 3.3
PCGF6Q9BYE7 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
PCGF6Q9BYE7 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC35.66■■■■□ 3.3
PCGF6Q9BYE7 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
PCGF6Q9BYE7 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
PCGF6Q9BYE7 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC35.65■■■■□ 3.3
PCGF6Q9BYE7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
PCGF6Q9BYE7 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
PCGF6Q9BYE7 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
PCGF6Q9BYE7 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
PCGF6Q9BYE7 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
PCGF6Q9BYE7 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
PCGF6Q9BYE7 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC35.63■■■■□ 3.29
PCGF6Q9BYE7 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC35.63■■■■□ 3.29
PCGF6Q9BYE7 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
PCGF6Q9BYE7 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
PCGF6Q9BYE7 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC35.63■■■■□ 3.29
PCGF6Q9BYE7 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
PCGF6Q9BYE7 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
PCGF6Q9BYE7 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC35.62■■■■□ 3.29
PCGF6Q9BYE7 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
PCGF6Q9BYE7 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
PCGF6Q9BYE7 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
PCGF6Q9BYE7 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
PCGF6Q9BYE7 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms