Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY41

HDAC8, Histone deacetylase 8, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8Q9BY41 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HDAC8Q9BY41 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HDAC8Q9BY41 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HDAC8Q9BY41 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
HDAC8Q9BY41 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HDAC8Q9BY41 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
HDAC8Q9BY41 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HDAC8Q9BY41 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HDAC8Q9BY41 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HDAC8Q9BY41 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HDAC8Q9BY41 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HDAC8Q9BY41 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HDAC8Q9BY41 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HDAC8Q9BY41 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HDAC8Q9BY41 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HDAC8Q9BY41 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HDAC8Q9BY41 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HDAC8Q9BY41 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HDAC8Q9BY41 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HDAC8Q9BY41 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HDAC8Q9BY41 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HDAC8Q9BY41 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HDAC8Q9BY41 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
HDAC8Q9BY41 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HDAC8Q9BY41 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HDAC8Q9BY41 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HDAC8Q9BY41 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
HDAC8Q9BY41 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HDAC8Q9BY41 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HDAC8Q9BY41 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HDAC8Q9BY41 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HDAC8Q9BY41 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HDAC8Q9BY41 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HDAC8Q9BY41 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HDAC8Q9BY41 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
HDAC8Q9BY41 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HDAC8Q9BY41 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HDAC8Q9BY41 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
HDAC8Q9BY41 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HDAC8Q9BY41 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HDAC8Q9BY41 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HDAC8Q9BY41 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HDAC8Q9BY41 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HDAC8Q9BY41 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HDAC8Q9BY41 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HDAC8Q9BY41 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HDAC8Q9BY41 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HDAC8Q9BY41 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
HDAC8Q9BY41 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HDAC8Q9BY41 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HDAC8Q9BY41 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HDAC8Q9BY41 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
HDAC8Q9BY41 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HDAC8Q9BY41 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HDAC8Q9BY41 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HDAC8Q9BY41 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HDAC8Q9BY41 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HDAC8Q9BY41 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HDAC8Q9BY41 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HDAC8Q9BY41 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HDAC8Q9BY41 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HDAC8Q9BY41 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HDAC8Q9BY41 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HDAC8Q9BY41 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HDAC8Q9BY41 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HDAC8Q9BY41 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
HDAC8Q9BY41 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HDAC8Q9BY41 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HDAC8Q9BY41 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HDAC8Q9BY41 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HDAC8Q9BY41 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HDAC8Q9BY41 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HDAC8Q9BY41 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HDAC8Q9BY41 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HDAC8Q9BY41 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HDAC8Q9BY41 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HDAC8Q9BY41 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HDAC8Q9BY41 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HDAC8Q9BY41 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
HDAC8Q9BY41 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HDAC8Q9BY41 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
HDAC8Q9BY41 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HDAC8Q9BY41 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HDAC8Q9BY41 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HDAC8Q9BY41 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HDAC8Q9BY41 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HDAC8Q9BY41 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HDAC8Q9BY41 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HDAC8Q9BY41 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HDAC8Q9BY41 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HDAC8Q9BY41 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HDAC8Q9BY41 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HDAC8Q9BY41 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HDAC8Q9BY41 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HDAC8Q9BY41 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HDAC8Q9BY41 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HDAC8Q9BY41 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HDAC8Q9BY41 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HDAC8Q9BY41 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HDAC8Q9BY41 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms