Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY07

SLC4A5, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A5Q9BY07 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC4A5Q9BY07 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC4A5Q9BY07 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC4A5Q9BY07 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC4A5Q9BY07 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC4A5Q9BY07 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC4A5Q9BY07 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC4A5Q9BY07 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC4A5Q9BY07 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC4A5Q9BY07 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC4A5Q9BY07 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC4A5Q9BY07 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC4A5Q9BY07 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC4A5Q9BY07 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC4A5Q9BY07 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC4A5Q9BY07 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC4A5Q9BY07 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC4A5Q9BY07 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC4A5Q9BY07 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC4A5Q9BY07 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC4A5Q9BY07 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC4A5Q9BY07 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC4A5Q9BY07 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC4A5Q9BY07 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC4A5Q9BY07 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC4A5Q9BY07 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC4A5Q9BY07 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SLC4A5Q9BY07 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SLC4A5Q9BY07 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SLC4A5Q9BY07 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SLC4A5Q9BY07 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SLC4A5Q9BY07 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC4A5Q9BY07 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC4A5Q9BY07 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC4A5Q9BY07 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC4A5Q9BY07 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC4A5Q9BY07 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC4A5Q9BY07 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC4A5Q9BY07 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC4A5Q9BY07 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC4A5Q9BY07 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC4A5Q9BY07 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC4A5Q9BY07 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC4A5Q9BY07 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC4A5Q9BY07 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC4A5Q9BY07 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC4A5Q9BY07 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC4A5Q9BY07 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC4A5Q9BY07 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC4A5Q9BY07 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC4A5Q9BY07 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC4A5Q9BY07 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC4A5Q9BY07 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC4A5Q9BY07 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC4A5Q9BY07 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC4A5Q9BY07 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC4A5Q9BY07 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC4A5Q9BY07 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC4A5Q9BY07 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC4A5Q9BY07 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC4A5Q9BY07 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC4A5Q9BY07 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC4A5Q9BY07 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC4A5Q9BY07 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC4A5Q9BY07 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC4A5Q9BY07 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC4A5Q9BY07 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC4A5Q9BY07 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC4A5Q9BY07 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC4A5Q9BY07 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC4A5Q9BY07 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC4A5Q9BY07 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC4A5Q9BY07 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC4A5Q9BY07 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC4A5Q9BY07 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC4A5Q9BY07 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC4A5Q9BY07 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC4A5Q9BY07 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC4A5Q9BY07 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC4A5Q9BY07 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC4A5Q9BY07 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC4A5Q9BY07 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC4A5Q9BY07 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC4A5Q9BY07 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC4A5Q9BY07 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC4A5Q9BY07 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC4A5Q9BY07 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC4A5Q9BY07 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC4A5Q9BY07 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC4A5Q9BY07 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC4A5Q9BY07 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC4A5Q9BY07 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC4A5Q9BY07 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC4A5Q9BY07 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC4A5Q9BY07 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC4A5Q9BY07 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC4A5Q9BY07 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC4A5Q9BY07 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC4A5Q9BY07 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC4A5Q9BY07 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms