Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX40

LSM14B, Protein LSM14 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM14BQ9BX40 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LSM14BQ9BX40 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LSM14BQ9BX40 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LSM14BQ9BX40 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LSM14BQ9BX40 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LSM14BQ9BX40 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LSM14BQ9BX40 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LSM14BQ9BX40 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LSM14BQ9BX40 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LSM14BQ9BX40 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LSM14BQ9BX40 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LSM14BQ9BX40 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LSM14BQ9BX40 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LSM14BQ9BX40 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LSM14BQ9BX40 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LSM14BQ9BX40 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LSM14BQ9BX40 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LSM14BQ9BX40 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LSM14BQ9BX40 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
LSM14BQ9BX40 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LSM14BQ9BX40 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LSM14BQ9BX40 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LSM14BQ9BX40 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LSM14BQ9BX40 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LSM14BQ9BX40 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LSM14BQ9BX40 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LSM14BQ9BX40 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LSM14BQ9BX40 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LSM14BQ9BX40 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LSM14BQ9BX40 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LSM14BQ9BX40 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LSM14BQ9BX40 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LSM14BQ9BX40 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
LSM14BQ9BX40 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
LSM14BQ9BX40 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
LSM14BQ9BX40 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
LSM14BQ9BX40 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LSM14BQ9BX40 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LSM14BQ9BX40 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
LSM14BQ9BX40 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LSM14BQ9BX40 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LSM14BQ9BX40 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LSM14BQ9BX40 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LSM14BQ9BX40 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
LSM14BQ9BX40 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LSM14BQ9BX40 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LSM14BQ9BX40 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LSM14BQ9BX40 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LSM14BQ9BX40 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LSM14BQ9BX40 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LSM14BQ9BX40 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
LSM14BQ9BX40 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LSM14BQ9BX40 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LSM14BQ9BX40 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LSM14BQ9BX40 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LSM14BQ9BX40 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LSM14BQ9BX40 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LSM14BQ9BX40 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LSM14BQ9BX40 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LSM14BQ9BX40 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LSM14BQ9BX40 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LSM14BQ9BX40 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LSM14BQ9BX40 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LSM14BQ9BX40 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LSM14BQ9BX40 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LSM14BQ9BX40 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LSM14BQ9BX40 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LSM14BQ9BX40 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LSM14BQ9BX40 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LSM14BQ9BX40 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LSM14BQ9BX40 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LSM14BQ9BX40 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LSM14BQ9BX40 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LSM14BQ9BX40 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LSM14BQ9BX40 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LSM14BQ9BX40 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LSM14BQ9BX40 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LSM14BQ9BX40 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LSM14BQ9BX40 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LSM14BQ9BX40 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LSM14BQ9BX40 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LSM14BQ9BX40 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LSM14BQ9BX40 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LSM14BQ9BX40 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LSM14BQ9BX40 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LSM14BQ9BX40 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LSM14BQ9BX40 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LSM14BQ9BX40 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LSM14BQ9BX40 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LSM14BQ9BX40 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LSM14BQ9BX40 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LSM14BQ9BX40 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LSM14BQ9BX40 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LSM14BQ9BX40 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LSM14BQ9BX40 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LSM14BQ9BX40 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LSM14BQ9BX40 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
LSM14BQ9BX40 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
LSM14BQ9BX40 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
LSM14BQ9BX40 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms