Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWJ5

SF3B5, Splicing factor 3B subunit 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B5Q9BWJ5 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SF3B5Q9BWJ5 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SF3B5Q9BWJ5 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SF3B5Q9BWJ5 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SF3B5Q9BWJ5 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SF3B5Q9BWJ5 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SF3B5Q9BWJ5 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SF3B5Q9BWJ5 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SF3B5Q9BWJ5 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SF3B5Q9BWJ5 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SF3B5Q9BWJ5 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SF3B5Q9BWJ5 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SF3B5Q9BWJ5 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SF3B5Q9BWJ5 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SF3B5Q9BWJ5 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SF3B5Q9BWJ5 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SF3B5Q9BWJ5 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SF3B5Q9BWJ5 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SF3B5Q9BWJ5 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SF3B5Q9BWJ5 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SF3B5Q9BWJ5 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SF3B5Q9BWJ5 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SF3B5Q9BWJ5 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SF3B5Q9BWJ5 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SF3B5Q9BWJ5 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SF3B5Q9BWJ5 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SF3B5Q9BWJ5 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SF3B5Q9BWJ5 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SF3B5Q9BWJ5 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SF3B5Q9BWJ5 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SF3B5Q9BWJ5 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SF3B5Q9BWJ5 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SF3B5Q9BWJ5 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SF3B5Q9BWJ5 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SF3B5Q9BWJ5 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SF3B5Q9BWJ5 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SF3B5Q9BWJ5 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SF3B5Q9BWJ5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SF3B5Q9BWJ5 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SF3B5Q9BWJ5 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SF3B5Q9BWJ5 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SF3B5Q9BWJ5 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SF3B5Q9BWJ5 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SF3B5Q9BWJ5 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SF3B5Q9BWJ5 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SF3B5Q9BWJ5 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SF3B5Q9BWJ5 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SF3B5Q9BWJ5 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SF3B5Q9BWJ5 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SF3B5Q9BWJ5 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SF3B5Q9BWJ5 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SF3B5Q9BWJ5 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SF3B5Q9BWJ5 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SF3B5Q9BWJ5 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SF3B5Q9BWJ5 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SF3B5Q9BWJ5 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SF3B5Q9BWJ5 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SF3B5Q9BWJ5 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SF3B5Q9BWJ5 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SF3B5Q9BWJ5 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SF3B5Q9BWJ5 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SF3B5Q9BWJ5 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SF3B5Q9BWJ5 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SF3B5Q9BWJ5 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SF3B5Q9BWJ5 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SF3B5Q9BWJ5 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SF3B5Q9BWJ5 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SF3B5Q9BWJ5 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SF3B5Q9BWJ5 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SF3B5Q9BWJ5 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SF3B5Q9BWJ5 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SF3B5Q9BWJ5 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SF3B5Q9BWJ5 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SF3B5Q9BWJ5 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SF3B5Q9BWJ5 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SF3B5Q9BWJ5 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SF3B5Q9BWJ5 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SF3B5Q9BWJ5 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SF3B5Q9BWJ5 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SF3B5Q9BWJ5 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SF3B5Q9BWJ5 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SF3B5Q9BWJ5 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SF3B5Q9BWJ5 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SF3B5Q9BWJ5 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SF3B5Q9BWJ5 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SF3B5Q9BWJ5 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SF3B5Q9BWJ5 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SF3B5Q9BWJ5 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SF3B5Q9BWJ5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SF3B5Q9BWJ5 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SF3B5Q9BWJ5 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SF3B5Q9BWJ5 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SF3B5Q9BWJ5 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SF3B5Q9BWJ5 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SF3B5Q9BWJ5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SF3B5Q9BWJ5 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SF3B5Q9BWJ5 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SF3B5Q9BWJ5 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SF3B5Q9BWJ5 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SF3B5Q9BWJ5 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms