Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWG6

SCNM1, Sodium channel modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCNM1Q9BWG6 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCNM1Q9BWG6 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCNM1Q9BWG6 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCNM1Q9BWG6 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCNM1Q9BWG6 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCNM1Q9BWG6 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SCNM1Q9BWG6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCNM1Q9BWG6 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCNM1Q9BWG6 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCNM1Q9BWG6 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCNM1Q9BWG6 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCNM1Q9BWG6 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCNM1Q9BWG6 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SCNM1Q9BWG6 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCNM1Q9BWG6 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCNM1Q9BWG6 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCNM1Q9BWG6 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCNM1Q9BWG6 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCNM1Q9BWG6 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCNM1Q9BWG6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCNM1Q9BWG6 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCNM1Q9BWG6 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCNM1Q9BWG6 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCNM1Q9BWG6 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCNM1Q9BWG6 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCNM1Q9BWG6 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCNM1Q9BWG6 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCNM1Q9BWG6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCNM1Q9BWG6 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCNM1Q9BWG6 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCNM1Q9BWG6 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCNM1Q9BWG6 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SCNM1Q9BWG6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCNM1Q9BWG6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCNM1Q9BWG6 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCNM1Q9BWG6 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCNM1Q9BWG6 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCNM1Q9BWG6 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCNM1Q9BWG6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCNM1Q9BWG6 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCNM1Q9BWG6 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCNM1Q9BWG6 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCNM1Q9BWG6 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCNM1Q9BWG6 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCNM1Q9BWG6 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SCNM1Q9BWG6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SCNM1Q9BWG6 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCNM1Q9BWG6 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCNM1Q9BWG6 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCNM1Q9BWG6 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCNM1Q9BWG6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCNM1Q9BWG6 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCNM1Q9BWG6 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCNM1Q9BWG6 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCNM1Q9BWG6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCNM1Q9BWG6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCNM1Q9BWG6 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCNM1Q9BWG6 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCNM1Q9BWG6 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SCNM1Q9BWG6 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCNM1Q9BWG6 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCNM1Q9BWG6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCNM1Q9BWG6 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SCNM1Q9BWG6 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCNM1Q9BWG6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCNM1Q9BWG6 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCNM1Q9BWG6 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCNM1Q9BWG6 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCNM1Q9BWG6 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCNM1Q9BWG6 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCNM1Q9BWG6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCNM1Q9BWG6 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCNM1Q9BWG6 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCNM1Q9BWG6 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCNM1Q9BWG6 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCNM1Q9BWG6 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCNM1Q9BWG6 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCNM1Q9BWG6 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCNM1Q9BWG6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SCNM1Q9BWG6 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCNM1Q9BWG6 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCNM1Q9BWG6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCNM1Q9BWG6 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCNM1Q9BWG6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCNM1Q9BWG6 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCNM1Q9BWG6 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SCNM1Q9BWG6 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCNM1Q9BWG6 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCNM1Q9BWG6 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCNM1Q9BWG6 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCNM1Q9BWG6 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCNM1Q9BWG6 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCNM1Q9BWG6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCNM1Q9BWG6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCNM1Q9BWG6 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCNM1Q9BWG6 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCNM1Q9BWG6 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SCNM1Q9BWG6 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCNM1Q9BWG6 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCNM1Q9BWG6 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms