Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVW6

SMIM2, Small integral membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM2Q9BVW6 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMIM2Q9BVW6 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SMIM2Q9BVW6 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMIM2Q9BVW6 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMIM2Q9BVW6 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMIM2Q9BVW6 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMIM2Q9BVW6 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMIM2Q9BVW6 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMIM2Q9BVW6 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMIM2Q9BVW6 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMIM2Q9BVW6 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMIM2Q9BVW6 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMIM2Q9BVW6 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMIM2Q9BVW6 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMIM2Q9BVW6 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMIM2Q9BVW6 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMIM2Q9BVW6 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMIM2Q9BVW6 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMIM2Q9BVW6 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMIM2Q9BVW6 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMIM2Q9BVW6 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMIM2Q9BVW6 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMIM2Q9BVW6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMIM2Q9BVW6 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMIM2Q9BVW6 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMIM2Q9BVW6 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMIM2Q9BVW6 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMIM2Q9BVW6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMIM2Q9BVW6 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMIM2Q9BVW6 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMIM2Q9BVW6 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMIM2Q9BVW6 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMIM2Q9BVW6 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMIM2Q9BVW6 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMIM2Q9BVW6 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMIM2Q9BVW6 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMIM2Q9BVW6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMIM2Q9BVW6 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMIM2Q9BVW6 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMIM2Q9BVW6 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMIM2Q9BVW6 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMIM2Q9BVW6 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMIM2Q9BVW6 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMIM2Q9BVW6 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMIM2Q9BVW6 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMIM2Q9BVW6 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMIM2Q9BVW6 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMIM2Q9BVW6 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMIM2Q9BVW6 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMIM2Q9BVW6 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMIM2Q9BVW6 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMIM2Q9BVW6 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMIM2Q9BVW6 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMIM2Q9BVW6 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMIM2Q9BVW6 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMIM2Q9BVW6 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMIM2Q9BVW6 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMIM2Q9BVW6 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMIM2Q9BVW6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMIM2Q9BVW6 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMIM2Q9BVW6 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMIM2Q9BVW6 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMIM2Q9BVW6 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMIM2Q9BVW6 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMIM2Q9BVW6 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMIM2Q9BVW6 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMIM2Q9BVW6 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMIM2Q9BVW6 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMIM2Q9BVW6 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMIM2Q9BVW6 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMIM2Q9BVW6 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMIM2Q9BVW6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMIM2Q9BVW6 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMIM2Q9BVW6 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMIM2Q9BVW6 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM2Q9BVW6 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM2Q9BVW6 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM2Q9BVW6 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM2Q9BVW6 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM2Q9BVW6 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM2Q9BVW6 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM2Q9BVW6 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM2Q9BVW6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM2Q9BVW6 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM2Q9BVW6 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM2Q9BVW6 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMIM2Q9BVW6 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMIM2Q9BVW6 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMIM2Q9BVW6 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMIM2Q9BVW6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMIM2Q9BVW6 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMIM2Q9BVW6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMIM2Q9BVW6 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMIM2Q9BVW6 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMIM2Q9BVW6 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMIM2Q9BVW6 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMIM2Q9BVW6 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMIM2Q9BVW6 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMIM2Q9BVW6 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMIM2Q9BVW6 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms