Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVG4

PBDC1, Protein PBDC1, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBDC1Q9BVG4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PBDC1Q9BVG4 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PBDC1Q9BVG4 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PBDC1Q9BVG4 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PBDC1Q9BVG4 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PBDC1Q9BVG4 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PBDC1Q9BVG4 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PBDC1Q9BVG4 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PBDC1Q9BVG4 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PBDC1Q9BVG4 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PBDC1Q9BVG4 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PBDC1Q9BVG4 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PBDC1Q9BVG4 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PBDC1Q9BVG4 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PBDC1Q9BVG4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PBDC1Q9BVG4 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PBDC1Q9BVG4 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PBDC1Q9BVG4 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PBDC1Q9BVG4 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PBDC1Q9BVG4 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PBDC1Q9BVG4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PBDC1Q9BVG4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PBDC1Q9BVG4 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PBDC1Q9BVG4 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PBDC1Q9BVG4 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PBDC1Q9BVG4 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PBDC1Q9BVG4 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PBDC1Q9BVG4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PBDC1Q9BVG4 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PBDC1Q9BVG4 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PBDC1Q9BVG4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PBDC1Q9BVG4 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PBDC1Q9BVG4 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PBDC1Q9BVG4 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PBDC1Q9BVG4 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PBDC1Q9BVG4 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PBDC1Q9BVG4 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PBDC1Q9BVG4 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PBDC1Q9BVG4 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PBDC1Q9BVG4 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PBDC1Q9BVG4 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PBDC1Q9BVG4 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PBDC1Q9BVG4 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PBDC1Q9BVG4 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PBDC1Q9BVG4 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PBDC1Q9BVG4 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PBDC1Q9BVG4 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PBDC1Q9BVG4 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PBDC1Q9BVG4 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PBDC1Q9BVG4 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PBDC1Q9BVG4 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PBDC1Q9BVG4 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PBDC1Q9BVG4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PBDC1Q9BVG4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PBDC1Q9BVG4 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PBDC1Q9BVG4 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PBDC1Q9BVG4 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PBDC1Q9BVG4 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PBDC1Q9BVG4 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PBDC1Q9BVG4 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PBDC1Q9BVG4 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PBDC1Q9BVG4 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PBDC1Q9BVG4 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PBDC1Q9BVG4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PBDC1Q9BVG4 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PBDC1Q9BVG4 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PBDC1Q9BVG4 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PBDC1Q9BVG4 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PBDC1Q9BVG4 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PBDC1Q9BVG4 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PBDC1Q9BVG4 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PBDC1Q9BVG4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PBDC1Q9BVG4 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PBDC1Q9BVG4 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PBDC1Q9BVG4 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PBDC1Q9BVG4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PBDC1Q9BVG4 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PBDC1Q9BVG4 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PBDC1Q9BVG4 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PBDC1Q9BVG4 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PBDC1Q9BVG4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PBDC1Q9BVG4 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PBDC1Q9BVG4 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PBDC1Q9BVG4 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PBDC1Q9BVG4 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PBDC1Q9BVG4 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PBDC1Q9BVG4 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PBDC1Q9BVG4 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PBDC1Q9BVG4 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PBDC1Q9BVG4 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PBDC1Q9BVG4 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PBDC1Q9BVG4 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PBDC1Q9BVG4 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PBDC1Q9BVG4 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PBDC1Q9BVG4 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PBDC1Q9BVG4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PBDC1Q9BVG4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PBDC1Q9BVG4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PBDC1Q9BVG4 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PBDC1Q9BVG4 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms