Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA1

TUBB2B, Tubulin beta-2B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB2BQ9BVA1 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TUBB2BQ9BVA1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TUBB2BQ9BVA1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TUBB2BQ9BVA1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TUBB2BQ9BVA1 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TUBB2BQ9BVA1 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TUBB2BQ9BVA1 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TUBB2BQ9BVA1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TUBB2BQ9BVA1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TUBB2BQ9BVA1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TUBB2BQ9BVA1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TUBB2BQ9BVA1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TUBB2BQ9BVA1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TUBB2BQ9BVA1 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TUBB2BQ9BVA1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TUBB2BQ9BVA1 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TUBB2BQ9BVA1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TUBB2BQ9BVA1 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TUBB2BQ9BVA1 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TUBB2BQ9BVA1 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TUBB2BQ9BVA1 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TUBB2BQ9BVA1 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TUBB2BQ9BVA1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TUBB2BQ9BVA1 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TUBB2BQ9BVA1 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TUBB2BQ9BVA1 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TUBB2BQ9BVA1 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TUBB2BQ9BVA1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TUBB2BQ9BVA1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TUBB2BQ9BVA1 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TUBB2BQ9BVA1 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TUBB2BQ9BVA1 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TUBB2BQ9BVA1 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TUBB2BQ9BVA1 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TUBB2BQ9BVA1 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TUBB2BQ9BVA1 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TUBB2BQ9BVA1 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TUBB2BQ9BVA1 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TUBB2BQ9BVA1 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TUBB2BQ9BVA1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TUBB2BQ9BVA1 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TUBB2BQ9BVA1 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TUBB2BQ9BVA1 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TUBB2BQ9BVA1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TUBB2BQ9BVA1 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TUBB2BQ9BVA1 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TUBB2BQ9BVA1 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TUBB2BQ9BVA1 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TUBB2BQ9BVA1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TUBB2BQ9BVA1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TUBB2BQ9BVA1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TUBB2BQ9BVA1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TUBB2BQ9BVA1 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TUBB2BQ9BVA1 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TUBB2BQ9BVA1 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TUBB2BQ9BVA1 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TUBB2BQ9BVA1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TUBB2BQ9BVA1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TUBB2BQ9BVA1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TUBB2BQ9BVA1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TUBB2BQ9BVA1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TUBB2BQ9BVA1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TUBB2BQ9BVA1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TUBB2BQ9BVA1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TUBB2BQ9BVA1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TUBB2BQ9BVA1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TUBB2BQ9BVA1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TUBB2BQ9BVA1 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TUBB2BQ9BVA1 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TUBB2BQ9BVA1 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TUBB2BQ9BVA1 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TUBB2BQ9BVA1 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TUBB2BQ9BVA1 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TUBB2BQ9BVA1 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TUBB2BQ9BVA1 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TUBB2BQ9BVA1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TUBB2BQ9BVA1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TUBB2BQ9BVA1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TUBB2BQ9BVA1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TUBB2BQ9BVA1 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TUBB2BQ9BVA1 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TUBB2BQ9BVA1 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TUBB2BQ9BVA1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TUBB2BQ9BVA1 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TUBB2BQ9BVA1 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TUBB2BQ9BVA1 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TUBB2BQ9BVA1 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TUBB2BQ9BVA1 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TUBB2BQ9BVA1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TUBB2BQ9BVA1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TUBB2BQ9BVA1 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TUBB2BQ9BVA1 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TUBB2BQ9BVA1 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TUBB2BQ9BVA1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TUBB2BQ9BVA1 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TUBB2BQ9BVA1 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TUBB2BQ9BVA1 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TUBB2BQ9BVA1 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TUBB2BQ9BVA1 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TUBB2BQ9BVA1 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms