Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV44

THUMPD3, THUMP domain-containing protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD3Q9BV44 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
THUMPD3Q9BV44 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
THUMPD3Q9BV44 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
THUMPD3Q9BV44 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
THUMPD3Q9BV44 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
THUMPD3Q9BV44 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
THUMPD3Q9BV44 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
THUMPD3Q9BV44 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
THUMPD3Q9BV44 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
THUMPD3Q9BV44 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
THUMPD3Q9BV44 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
THUMPD3Q9BV44 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
THUMPD3Q9BV44 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
THUMPD3Q9BV44 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
THUMPD3Q9BV44 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
THUMPD3Q9BV44 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
THUMPD3Q9BV44 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
THUMPD3Q9BV44 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
THUMPD3Q9BV44 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
THUMPD3Q9BV44 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
THUMPD3Q9BV44 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
THUMPD3Q9BV44 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
THUMPD3Q9BV44 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
THUMPD3Q9BV44 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
THUMPD3Q9BV44 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
THUMPD3Q9BV44 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
THUMPD3Q9BV44 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
THUMPD3Q9BV44 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
THUMPD3Q9BV44 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
THUMPD3Q9BV44 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
THUMPD3Q9BV44 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
THUMPD3Q9BV44 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
THUMPD3Q9BV44 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
THUMPD3Q9BV44 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
THUMPD3Q9BV44 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
THUMPD3Q9BV44 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
THUMPD3Q9BV44 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
THUMPD3Q9BV44 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
THUMPD3Q9BV44 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
THUMPD3Q9BV44 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
THUMPD3Q9BV44 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
THUMPD3Q9BV44 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
THUMPD3Q9BV44 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
THUMPD3Q9BV44 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
THUMPD3Q9BV44 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
THUMPD3Q9BV44 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
THUMPD3Q9BV44 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
THUMPD3Q9BV44 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
THUMPD3Q9BV44 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
THUMPD3Q9BV44 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
THUMPD3Q9BV44 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
THUMPD3Q9BV44 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
THUMPD3Q9BV44 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
THUMPD3Q9BV44 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
THUMPD3Q9BV44 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
THUMPD3Q9BV44 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
THUMPD3Q9BV44 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
THUMPD3Q9BV44 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
THUMPD3Q9BV44 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
THUMPD3Q9BV44 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
THUMPD3Q9BV44 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
THUMPD3Q9BV44 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
THUMPD3Q9BV44 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
THUMPD3Q9BV44 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
THUMPD3Q9BV44 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
THUMPD3Q9BV44 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
THUMPD3Q9BV44 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
THUMPD3Q9BV44 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
THUMPD3Q9BV44 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
THUMPD3Q9BV44 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
THUMPD3Q9BV44 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
THUMPD3Q9BV44 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
THUMPD3Q9BV44 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
THUMPD3Q9BV44 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
THUMPD3Q9BV44 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
THUMPD3Q9BV44 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
THUMPD3Q9BV44 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
THUMPD3Q9BV44 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
THUMPD3Q9BV44 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
THUMPD3Q9BV44 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
THUMPD3Q9BV44 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
THUMPD3Q9BV44 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
THUMPD3Q9BV44 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
THUMPD3Q9BV44 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
THUMPD3Q9BV44 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
THUMPD3Q9BV44 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
THUMPD3Q9BV44 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
THUMPD3Q9BV44 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
THUMPD3Q9BV44 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
THUMPD3Q9BV44 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
THUMPD3Q9BV44 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
THUMPD3Q9BV44 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
THUMPD3Q9BV44 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
THUMPD3Q9BV44 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
THUMPD3Q9BV44 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
THUMPD3Q9BV44 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
THUMPD3Q9BV44 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
THUMPD3Q9BV44 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
THUMPD3Q9BV44 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
THUMPD3Q9BV44 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms