Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV40

VAMP8, Vesicle-associated membrane protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP8Q9BV40 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
VAMP8Q9BV40 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VAMP8Q9BV40 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VAMP8Q9BV40 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VAMP8Q9BV40 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VAMP8Q9BV40 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VAMP8Q9BV40 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VAMP8Q9BV40 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VAMP8Q9BV40 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
VAMP8Q9BV40 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
VAMP8Q9BV40 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VAMP8Q9BV40 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
VAMP8Q9BV40 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VAMP8Q9BV40 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VAMP8Q9BV40 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VAMP8Q9BV40 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
VAMP8Q9BV40 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VAMP8Q9BV40 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VAMP8Q9BV40 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VAMP8Q9BV40 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VAMP8Q9BV40 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
VAMP8Q9BV40 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
VAMP8Q9BV40 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VAMP8Q9BV40 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
VAMP8Q9BV40 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
VAMP8Q9BV40 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VAMP8Q9BV40 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VAMP8Q9BV40 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VAMP8Q9BV40 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VAMP8Q9BV40 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VAMP8Q9BV40 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VAMP8Q9BV40 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VAMP8Q9BV40 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
VAMP8Q9BV40 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
VAMP8Q9BV40 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
VAMP8Q9BV40 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
VAMP8Q9BV40 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VAMP8Q9BV40 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VAMP8Q9BV40 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VAMP8Q9BV40 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
VAMP8Q9BV40 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
VAMP8Q9BV40 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
VAMP8Q9BV40 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
VAMP8Q9BV40 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
VAMP8Q9BV40 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
VAMP8Q9BV40 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
VAMP8Q9BV40 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VAMP8Q9BV40 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VAMP8Q9BV40 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VAMP8Q9BV40 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VAMP8Q9BV40 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VAMP8Q9BV40 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VAMP8Q9BV40 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VAMP8Q9BV40 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VAMP8Q9BV40 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VAMP8Q9BV40 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VAMP8Q9BV40 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VAMP8Q9BV40 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VAMP8Q9BV40 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VAMP8Q9BV40 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VAMP8Q9BV40 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
VAMP8Q9BV40 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VAMP8Q9BV40 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
VAMP8Q9BV40 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
VAMP8Q9BV40 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VAMP8Q9BV40 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
VAMP8Q9BV40 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VAMP8Q9BV40 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
VAMP8Q9BV40 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VAMP8Q9BV40 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
VAMP8Q9BV40 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VAMP8Q9BV40 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VAMP8Q9BV40 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VAMP8Q9BV40 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VAMP8Q9BV40 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VAMP8Q9BV40 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VAMP8Q9BV40 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VAMP8Q9BV40 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VAMP8Q9BV40 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VAMP8Q9BV40 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VAMP8Q9BV40 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VAMP8Q9BV40 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VAMP8Q9BV40 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
VAMP8Q9BV40 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VAMP8Q9BV40 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VAMP8Q9BV40 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VAMP8Q9BV40 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VAMP8Q9BV40 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VAMP8Q9BV40 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VAMP8Q9BV40 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VAMP8Q9BV40 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VAMP8Q9BV40 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VAMP8Q9BV40 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VAMP8Q9BV40 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VAMP8Q9BV40 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VAMP8Q9BV40 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VAMP8Q9BV40 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VAMP8Q9BV40 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VAMP8Q9BV40 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VAMP8Q9BV40 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1100.8 ms