Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV19

C1orf50, Uncharacterized protein C1orf50, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf50Q9BV19 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C1orf50Q9BV19 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C1orf50Q9BV19 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C1orf50Q9BV19 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C1orf50Q9BV19 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C1orf50Q9BV19 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C1orf50Q9BV19 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C1orf50Q9BV19 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C1orf50Q9BV19 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C1orf50Q9BV19 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C1orf50Q9BV19 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C1orf50Q9BV19 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C1orf50Q9BV19 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C1orf50Q9BV19 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C1orf50Q9BV19 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C1orf50Q9BV19 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C1orf50Q9BV19 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C1orf50Q9BV19 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C1orf50Q9BV19 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C1orf50Q9BV19 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C1orf50Q9BV19 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C1orf50Q9BV19 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C1orf50Q9BV19 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C1orf50Q9BV19 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
C1orf50Q9BV19 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C1orf50Q9BV19 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C1orf50Q9BV19 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C1orf50Q9BV19 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C1orf50Q9BV19 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C1orf50Q9BV19 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C1orf50Q9BV19 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C1orf50Q9BV19 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C1orf50Q9BV19 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C1orf50Q9BV19 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C1orf50Q9BV19 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C1orf50Q9BV19 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
C1orf50Q9BV19 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
C1orf50Q9BV19 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
C1orf50Q9BV19 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C1orf50Q9BV19 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C1orf50Q9BV19 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C1orf50Q9BV19 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C1orf50Q9BV19 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C1orf50Q9BV19 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C1orf50Q9BV19 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C1orf50Q9BV19 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C1orf50Q9BV19 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C1orf50Q9BV19 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C1orf50Q9BV19 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
C1orf50Q9BV19 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C1orf50Q9BV19 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C1orf50Q9BV19 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C1orf50Q9BV19 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C1orf50Q9BV19 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C1orf50Q9BV19 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C1orf50Q9BV19 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C1orf50Q9BV19 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C1orf50Q9BV19 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C1orf50Q9BV19 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C1orf50Q9BV19 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C1orf50Q9BV19 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C1orf50Q9BV19 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C1orf50Q9BV19 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C1orf50Q9BV19 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C1orf50Q9BV19 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C1orf50Q9BV19 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C1orf50Q9BV19 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
C1orf50Q9BV19 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C1orf50Q9BV19 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C1orf50Q9BV19 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C1orf50Q9BV19 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C1orf50Q9BV19 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C1orf50Q9BV19 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C1orf50Q9BV19 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C1orf50Q9BV19 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C1orf50Q9BV19 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C1orf50Q9BV19 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C1orf50Q9BV19 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C1orf50Q9BV19 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C1orf50Q9BV19 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C1orf50Q9BV19 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C1orf50Q9BV19 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C1orf50Q9BV19 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C1orf50Q9BV19 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C1orf50Q9BV19 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C1orf50Q9BV19 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C1orf50Q9BV19 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
C1orf50Q9BV19 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C1orf50Q9BV19 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
C1orf50Q9BV19 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C1orf50Q9BV19 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C1orf50Q9BV19 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C1orf50Q9BV19 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C1orf50Q9BV19 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C1orf50Q9BV19 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C1orf50Q9BV19 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C1orf50Q9BV19 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C1orf50Q9BV19 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C1orf50Q9BV19 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C1orf50Q9BV19 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms