Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C9orf16Q9BUW7 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C9orf16Q9BUW7 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C9orf16Q9BUW7 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C9orf16Q9BUW7 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C9orf16Q9BUW7 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
C9orf16Q9BUW7 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C9orf16Q9BUW7 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
C9orf16Q9BUW7 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C9orf16Q9BUW7 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C9orf16Q9BUW7 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C9orf16Q9BUW7 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C9orf16Q9BUW7 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C9orf16Q9BUW7 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C9orf16Q9BUW7 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C9orf16Q9BUW7 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C9orf16Q9BUW7 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C9orf16Q9BUW7 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C9orf16Q9BUW7 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C9orf16Q9BUW7 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C9orf16Q9BUW7 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C9orf16Q9BUW7 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C9orf16Q9BUW7 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C9orf16Q9BUW7 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C9orf16Q9BUW7 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C9orf16Q9BUW7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C9orf16Q9BUW7 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C9orf16Q9BUW7 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C9orf16Q9BUW7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C9orf16Q9BUW7 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C9orf16Q9BUW7 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C9orf16Q9BUW7 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C9orf16Q9BUW7 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C9orf16Q9BUW7 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C9orf16Q9BUW7 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
C9orf16Q9BUW7 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C9orf16Q9BUW7 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C9orf16Q9BUW7 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C9orf16Q9BUW7 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C9orf16Q9BUW7 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C9orf16Q9BUW7 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C9orf16Q9BUW7 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C9orf16Q9BUW7 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
C9orf16Q9BUW7 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C9orf16Q9BUW7 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C9orf16Q9BUW7 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C9orf16Q9BUW7 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C9orf16Q9BUW7 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
C9orf16Q9BUW7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
C9orf16Q9BUW7 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
C9orf16Q9BUW7 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
C9orf16Q9BUW7 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C9orf16Q9BUW7 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C9orf16Q9BUW7 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C9orf16Q9BUW7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C9orf16Q9BUW7 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C9orf16Q9BUW7 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C9orf16Q9BUW7 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C9orf16Q9BUW7 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
C9orf16Q9BUW7 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C9orf16Q9BUW7 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C9orf16Q9BUW7 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C9orf16Q9BUW7 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C9orf16Q9BUW7 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C9orf16Q9BUW7 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
C9orf16Q9BUW7 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
C9orf16Q9BUW7 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
C9orf16Q9BUW7 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
C9orf16Q9BUW7 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
C9orf16Q9BUW7 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
C9orf16Q9BUW7 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
C9orf16Q9BUW7 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
C9orf16Q9BUW7 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
C9orf16Q9BUW7 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C9orf16Q9BUW7 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C9orf16Q9BUW7 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C9orf16Q9BUW7 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C9orf16Q9BUW7 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C9orf16Q9BUW7 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C9orf16Q9BUW7 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C9orf16Q9BUW7 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C9orf16Q9BUW7 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
C9orf16Q9BUW7 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C9orf16Q9BUW7 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C9orf16Q9BUW7 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C9orf16Q9BUW7 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C9orf16Q9BUW7 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C9orf16Q9BUW7 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
C9orf16Q9BUW7 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C9orf16Q9BUW7 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C9orf16Q9BUW7 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C9orf16Q9BUW7 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C9orf16Q9BUW7 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C9orf16Q9BUW7 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C9orf16Q9BUW7 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
C9orf16Q9BUW7 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
C9orf16Q9BUW7 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C9orf16Q9BUW7 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C9orf16Q9BUW7 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C9orf16Q9BUW7 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms