Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSU1

C16orf70, UPF0183 protein C16orf70, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf70Q9BSU1 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
C16orf70Q9BSU1 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
C16orf70Q9BSU1 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
C16orf70Q9BSU1 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
C16orf70Q9BSU1 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
C16orf70Q9BSU1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
C16orf70Q9BSU1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
C16orf70Q9BSU1 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
C16orf70Q9BSU1 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
C16orf70Q9BSU1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
C16orf70Q9BSU1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
C16orf70Q9BSU1 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
C16orf70Q9BSU1 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
C16orf70Q9BSU1 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
C16orf70Q9BSU1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
C16orf70Q9BSU1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
C16orf70Q9BSU1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
C16orf70Q9BSU1 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
C16orf70Q9BSU1 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
C16orf70Q9BSU1 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
C16orf70Q9BSU1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
C16orf70Q9BSU1 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
C16orf70Q9BSU1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
C16orf70Q9BSU1 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
C16orf70Q9BSU1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
C16orf70Q9BSU1 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
C16orf70Q9BSU1 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
C16orf70Q9BSU1 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
C16orf70Q9BSU1 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
C16orf70Q9BSU1 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
C16orf70Q9BSU1 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
C16orf70Q9BSU1 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
C16orf70Q9BSU1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
C16orf70Q9BSU1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
C16orf70Q9BSU1 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
C16orf70Q9BSU1 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
C16orf70Q9BSU1 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
C16orf70Q9BSU1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
C16orf70Q9BSU1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
C16orf70Q9BSU1 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
C16orf70Q9BSU1 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
C16orf70Q9BSU1 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
C16orf70Q9BSU1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
C16orf70Q9BSU1 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
C16orf70Q9BSU1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
C16orf70Q9BSU1 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
C16orf70Q9BSU1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
C16orf70Q9BSU1 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
C16orf70Q9BSU1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
C16orf70Q9BSU1 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
C16orf70Q9BSU1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
C16orf70Q9BSU1 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
C16orf70Q9BSU1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
C16orf70Q9BSU1 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
C16orf70Q9BSU1 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
C16orf70Q9BSU1 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
C16orf70Q9BSU1 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
C16orf70Q9BSU1 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
C16orf70Q9BSU1 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
C16orf70Q9BSU1 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
C16orf70Q9BSU1 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
C16orf70Q9BSU1 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
C16orf70Q9BSU1 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
C16orf70Q9BSU1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
C16orf70Q9BSU1 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
C16orf70Q9BSU1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
C16orf70Q9BSU1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
C16orf70Q9BSU1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
C16orf70Q9BSU1 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
C16orf70Q9BSU1 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
C16orf70Q9BSU1 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
C16orf70Q9BSU1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
C16orf70Q9BSU1 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
C16orf70Q9BSU1 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
C16orf70Q9BSU1 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
C16orf70Q9BSU1 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
C16orf70Q9BSU1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
C16orf70Q9BSU1 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
C16orf70Q9BSU1 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
C16orf70Q9BSU1 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
C16orf70Q9BSU1 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
C16orf70Q9BSU1 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
C16orf70Q9BSU1 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
C16orf70Q9BSU1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
C16orf70Q9BSU1 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
C16orf70Q9BSU1 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
C16orf70Q9BSU1 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
C16orf70Q9BSU1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
C16orf70Q9BSU1 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
C16orf70Q9BSU1 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
C16orf70Q9BSU1 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
C16orf70Q9BSU1 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
C16orf70Q9BSU1 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
C16orf70Q9BSU1 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
C16orf70Q9BSU1 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
C16orf70Q9BSU1 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
C16orf70Q9BSU1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
C16orf70Q9BSU1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
C16orf70Q9BSU1 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
C16orf70Q9BSU1 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms