Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
RTKNQ9BST9 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RTKNQ9BST9 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RTKNQ9BST9 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RTKNQ9BST9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RTKNQ9BST9 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RTKNQ9BST9 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RTKNQ9BST9 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RTKNQ9BST9 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RTKNQ9BST9 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RTKNQ9BST9 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RTKNQ9BST9 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RTKNQ9BST9 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RTKNQ9BST9 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RTKNQ9BST9 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RTKNQ9BST9 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RTKNQ9BST9 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RTKNQ9BST9 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RTKNQ9BST9 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RTKNQ9BST9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RTKNQ9BST9 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RTKNQ9BST9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RTKNQ9BST9 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RTKNQ9BST9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RTKNQ9BST9 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RTKNQ9BST9 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RTKNQ9BST9 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RTKNQ9BST9 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RTKNQ9BST9 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RTKNQ9BST9 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RTKNQ9BST9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RTKNQ9BST9 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RTKNQ9BST9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RTKNQ9BST9 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RTKNQ9BST9 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
RTKNQ9BST9 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RTKNQ9BST9 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RTKNQ9BST9 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RTKNQ9BST9 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
RTKNQ9BST9 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RTKNQ9BST9 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RTKNQ9BST9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RTKNQ9BST9 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RTKNQ9BST9 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RTKNQ9BST9 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RTKNQ9BST9 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RTKNQ9BST9 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RTKNQ9BST9 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RTKNQ9BST9 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RTKNQ9BST9 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RTKNQ9BST9 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RTKNQ9BST9 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RTKNQ9BST9 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RTKNQ9BST9 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RTKNQ9BST9 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RTKNQ9BST9 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RTKNQ9BST9 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RTKNQ9BST9 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RTKNQ9BST9 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RTKNQ9BST9 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RTKNQ9BST9 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RTKNQ9BST9 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RTKNQ9BST9 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RTKNQ9BST9 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RTKNQ9BST9 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RTKNQ9BST9 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RTKNQ9BST9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RTKNQ9BST9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RTKNQ9BST9 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RTKNQ9BST9 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RTKNQ9BST9 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RTKNQ9BST9 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RTKNQ9BST9 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RTKNQ9BST9 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RTKNQ9BST9 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RTKNQ9BST9 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RTKNQ9BST9 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RTKNQ9BST9 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RTKNQ9BST9 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RTKNQ9BST9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RTKNQ9BST9 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RTKNQ9BST9 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RTKNQ9BST9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RTKNQ9BST9 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RTKNQ9BST9 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RTKNQ9BST9 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RTKNQ9BST9 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RTKNQ9BST9 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RTKNQ9BST9 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RTKNQ9BST9 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RTKNQ9BST9 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RTKNQ9BST9 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RTKNQ9BST9 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RTKNQ9BST9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RTKNQ9BST9 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RTKNQ9BST9 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RTKNQ9BST9 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RTKNQ9BST9 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RTKNQ9BST9 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RTKNQ9BST9 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms