Protein–RNA interactions for Protein: Q9BS16

CENPK, Centromere protein K, humanhuman

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPKQ9BS16 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CENPKQ9BS16 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CENPKQ9BS16 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CENPKQ9BS16 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CENPKQ9BS16 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CENPKQ9BS16 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CENPKQ9BS16 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CENPKQ9BS16 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CENPKQ9BS16 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CENPKQ9BS16 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CENPKQ9BS16 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CENPKQ9BS16 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CENPKQ9BS16 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CENPKQ9BS16 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CENPKQ9BS16 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CENPKQ9BS16 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CENPKQ9BS16 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CENPKQ9BS16 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CENPKQ9BS16 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CENPKQ9BS16 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CENPKQ9BS16 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CENPKQ9BS16 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CENPKQ9BS16 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CENPKQ9BS16 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CENPKQ9BS16 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CENPKQ9BS16 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CENPKQ9BS16 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CENPKQ9BS16 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CENPKQ9BS16 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CENPKQ9BS16 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CENPKQ9BS16 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CENPKQ9BS16 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CENPKQ9BS16 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CENPKQ9BS16 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CENPKQ9BS16 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CENPKQ9BS16 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CENPKQ9BS16 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CENPKQ9BS16 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CENPKQ9BS16 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CENPKQ9BS16 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CENPKQ9BS16 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CENPKQ9BS16 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CENPKQ9BS16 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CENPKQ9BS16 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CENPKQ9BS16 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CENPKQ9BS16 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CENPKQ9BS16 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CENPKQ9BS16 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CENPKQ9BS16 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CENPKQ9BS16 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CENPKQ9BS16 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CENPKQ9BS16 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CENPKQ9BS16 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CENPKQ9BS16 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CENPKQ9BS16 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CENPKQ9BS16 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CENPKQ9BS16 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CENPKQ9BS16 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CENPKQ9BS16 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CENPKQ9BS16 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CENPKQ9BS16 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CENPKQ9BS16 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CENPKQ9BS16 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CENPKQ9BS16 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CENPKQ9BS16 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CENPKQ9BS16 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CENPKQ9BS16 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CENPKQ9BS16 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CENPKQ9BS16 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CENPKQ9BS16 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CENPKQ9BS16 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CENPKQ9BS16 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CENPKQ9BS16 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CENPKQ9BS16 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CENPKQ9BS16 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CENPKQ9BS16 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CENPKQ9BS16 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CENPKQ9BS16 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CENPKQ9BS16 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CENPKQ9BS16 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CENPKQ9BS16 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CENPKQ9BS16 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CENPKQ9BS16 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CENPKQ9BS16 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CENPKQ9BS16 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CENPKQ9BS16 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CENPKQ9BS16 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CENPKQ9BS16 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CENPKQ9BS16 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CENPKQ9BS16 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CENPKQ9BS16 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CENPKQ9BS16 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CENPKQ9BS16 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CENPKQ9BS16 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CENPKQ9BS16 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CENPKQ9BS16 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CENPKQ9BS16 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CENPKQ9BS16 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CENPKQ9BS16 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CENPKQ9BS16 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms