Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ83

SLX1A, Structure-specific endonuclease subunit SLX1, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLX1AQ9BQ83 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLX1AQ9BQ83 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLX1AQ9BQ83 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLX1AQ9BQ83 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLX1AQ9BQ83 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLX1AQ9BQ83 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLX1AQ9BQ83 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLX1AQ9BQ83 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLX1AQ9BQ83 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLX1AQ9BQ83 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SLX1AQ9BQ83 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLX1AQ9BQ83 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLX1AQ9BQ83 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLX1AQ9BQ83 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLX1AQ9BQ83 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLX1AQ9BQ83 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLX1AQ9BQ83 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLX1AQ9BQ83 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLX1AQ9BQ83 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLX1AQ9BQ83 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLX1AQ9BQ83 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLX1AQ9BQ83 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLX1AQ9BQ83 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLX1AQ9BQ83 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SLX1AQ9BQ83 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SLX1AQ9BQ83 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SLX1AQ9BQ83 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SLX1AQ9BQ83 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SLX1AQ9BQ83 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLX1AQ9BQ83 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLX1AQ9BQ83 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLX1AQ9BQ83 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLX1AQ9BQ83 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLX1AQ9BQ83 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLX1AQ9BQ83 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SLX1AQ9BQ83 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLX1AQ9BQ83 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLX1AQ9BQ83 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLX1AQ9BQ83 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLX1AQ9BQ83 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLX1AQ9BQ83 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLX1AQ9BQ83 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLX1AQ9BQ83 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLX1AQ9BQ83 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLX1AQ9BQ83 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLX1AQ9BQ83 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLX1AQ9BQ83 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLX1AQ9BQ83 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLX1AQ9BQ83 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLX1AQ9BQ83 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLX1AQ9BQ83 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLX1AQ9BQ83 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLX1AQ9BQ83 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLX1AQ9BQ83 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLX1AQ9BQ83 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLX1AQ9BQ83 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLX1AQ9BQ83 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLX1AQ9BQ83 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLX1AQ9BQ83 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLX1AQ9BQ83 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLX1AQ9BQ83 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLX1AQ9BQ83 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLX1AQ9BQ83 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLX1AQ9BQ83 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLX1AQ9BQ83 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLX1AQ9BQ83 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLX1AQ9BQ83 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLX1AQ9BQ83 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLX1AQ9BQ83 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLX1AQ9BQ83 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLX1AQ9BQ83 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLX1AQ9BQ83 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLX1AQ9BQ83 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLX1AQ9BQ83 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLX1AQ9BQ83 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLX1AQ9BQ83 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLX1AQ9BQ83 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLX1AQ9BQ83 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLX1AQ9BQ83 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLX1AQ9BQ83 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLX1AQ9BQ83 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLX1AQ9BQ83 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLX1AQ9BQ83 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLX1AQ9BQ83 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLX1AQ9BQ83 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLX1AQ9BQ83 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLX1AQ9BQ83 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLX1AQ9BQ83 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLX1AQ9BQ83 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLX1AQ9BQ83 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLX1AQ9BQ83 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLX1AQ9BQ83 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLX1AQ9BQ83 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SLX1AQ9BQ83 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLX1AQ9BQ83 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLX1AQ9BQ83 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLX1AQ9BQ83 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SLX1AQ9BQ83 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLX1AQ9BQ83 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLX1AQ9BQ83 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms