Protein–RNA interactions for Protein: Q99698

LYST, Lysosomal-trafficking regulator, humanhuman

Predictions only

Length 3,801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYSTQ99698 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LYSTQ99698 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LYSTQ99698 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LYSTQ99698 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LYSTQ99698 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LYSTQ99698 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LYSTQ99698 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LYSTQ99698 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LYSTQ99698 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LYSTQ99698 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LYSTQ99698 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
LYSTQ99698 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LYSTQ99698 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
LYSTQ99698 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LYSTQ99698 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LYSTQ99698 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LYSTQ99698 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LYSTQ99698 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LYSTQ99698 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LYSTQ99698 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LYSTQ99698 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LYSTQ99698 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LYSTQ99698 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LYSTQ99698 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LYSTQ99698 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LYSTQ99698 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LYSTQ99698 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LYSTQ99698 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LYSTQ99698 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LYSTQ99698 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LYSTQ99698 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LYSTQ99698 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LYSTQ99698 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LYSTQ99698 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LYSTQ99698 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LYSTQ99698 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LYSTQ99698 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LYSTQ99698 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
LYSTQ99698 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LYSTQ99698 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
LYSTQ99698 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
LYSTQ99698 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
LYSTQ99698 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
LYSTQ99698 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
LYSTQ99698 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
LYSTQ99698 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LYSTQ99698 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LYSTQ99698 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LYSTQ99698 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LYSTQ99698 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LYSTQ99698 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LYSTQ99698 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LYSTQ99698 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LYSTQ99698 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LYSTQ99698 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LYSTQ99698 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LYSTQ99698 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LYSTQ99698 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LYSTQ99698 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LYSTQ99698 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LYSTQ99698 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LYSTQ99698 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LYSTQ99698 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LYSTQ99698 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LYSTQ99698 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LYSTQ99698 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LYSTQ99698 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LYSTQ99698 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LYSTQ99698 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LYSTQ99698 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LYSTQ99698 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LYSTQ99698 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LYSTQ99698 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LYSTQ99698 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LYSTQ99698 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LYSTQ99698 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LYSTQ99698 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LYSTQ99698 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LYSTQ99698 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LYSTQ99698 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LYSTQ99698 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LYSTQ99698 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LYSTQ99698 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LYSTQ99698 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LYSTQ99698 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LYSTQ99698 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LYSTQ99698 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYSTQ99698 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYSTQ99698 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYSTQ99698 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYSTQ99698 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYSTQ99698 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYSTQ99698 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYSTQ99698 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYSTQ99698 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYSTQ99698 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYSTQ99698 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LYSTQ99698 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LYSTQ99698 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYSTQ99698 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms