Protein–RNA interactions for Protein: Q99674

CGREF1, Cell growth regulator with EF hand domain protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGREF1Q99674 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CGREF1Q99674 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CGREF1Q99674 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CGREF1Q99674 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CGREF1Q99674 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CGREF1Q99674 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CGREF1Q99674 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CGREF1Q99674 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CGREF1Q99674 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CGREF1Q99674 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CGREF1Q99674 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CGREF1Q99674 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CGREF1Q99674 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CGREF1Q99674 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CGREF1Q99674 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CGREF1Q99674 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CGREF1Q99674 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CGREF1Q99674 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CGREF1Q99674 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CGREF1Q99674 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CGREF1Q99674 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CGREF1Q99674 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CGREF1Q99674 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CGREF1Q99674 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CGREF1Q99674 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CGREF1Q99674 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CGREF1Q99674 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CGREF1Q99674 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CGREF1Q99674 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CGREF1Q99674 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CGREF1Q99674 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CGREF1Q99674 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CGREF1Q99674 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CGREF1Q99674 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CGREF1Q99674 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CGREF1Q99674 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CGREF1Q99674 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CGREF1Q99674 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CGREF1Q99674 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CGREF1Q99674 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CGREF1Q99674 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CGREF1Q99674 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CGREF1Q99674 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CGREF1Q99674 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CGREF1Q99674 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CGREF1Q99674 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CGREF1Q99674 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CGREF1Q99674 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CGREF1Q99674 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CGREF1Q99674 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CGREF1Q99674 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CGREF1Q99674 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CGREF1Q99674 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CGREF1Q99674 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CGREF1Q99674 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CGREF1Q99674 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CGREF1Q99674 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CGREF1Q99674 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CGREF1Q99674 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CGREF1Q99674 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CGREF1Q99674 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CGREF1Q99674 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CGREF1Q99674 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CGREF1Q99674 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CGREF1Q99674 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CGREF1Q99674 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CGREF1Q99674 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CGREF1Q99674 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CGREF1Q99674 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CGREF1Q99674 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CGREF1Q99674 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CGREF1Q99674 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CGREF1Q99674 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CGREF1Q99674 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CGREF1Q99674 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CGREF1Q99674 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CGREF1Q99674 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CGREF1Q99674 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CGREF1Q99674 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CGREF1Q99674 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CGREF1Q99674 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CGREF1Q99674 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CGREF1Q99674 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CGREF1Q99674 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CGREF1Q99674 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CGREF1Q99674 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CGREF1Q99674 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CGREF1Q99674 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CGREF1Q99674 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CGREF1Q99674 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CGREF1Q99674 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CGREF1Q99674 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CGREF1Q99674 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CGREF1Q99674 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CGREF1Q99674 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CGREF1Q99674 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CGREF1Q99674 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CGREF1Q99674 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CGREF1Q99674 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CGREF1Q99674 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms