Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VAT1Q99536 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VAT1Q99536 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VAT1Q99536 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VAT1Q99536 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VAT1Q99536 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VAT1Q99536 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VAT1Q99536 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VAT1Q99536 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VAT1Q99536 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VAT1Q99536 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VAT1Q99536 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VAT1Q99536 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VAT1Q99536 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VAT1Q99536 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VAT1Q99536 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VAT1Q99536 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VAT1Q99536 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VAT1Q99536 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VAT1Q99536 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VAT1Q99536 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VAT1Q99536 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VAT1Q99536 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
VAT1Q99536 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VAT1Q99536 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VAT1Q99536 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VAT1Q99536 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VAT1Q99536 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VAT1Q99536 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VAT1Q99536 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VAT1Q99536 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VAT1Q99536 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VAT1Q99536 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VAT1Q99536 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
VAT1Q99536 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VAT1Q99536 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VAT1Q99536 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VAT1Q99536 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VAT1Q99536 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VAT1Q99536 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VAT1Q99536 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VAT1Q99536 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VAT1Q99536 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VAT1Q99536 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VAT1Q99536 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VAT1Q99536 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VAT1Q99536 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VAT1Q99536 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VAT1Q99536 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VAT1Q99536 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VAT1Q99536 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VAT1Q99536 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VAT1Q99536 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VAT1Q99536 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VAT1Q99536 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VAT1Q99536 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VAT1Q99536 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VAT1Q99536 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VAT1Q99536 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
VAT1Q99536 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VAT1Q99536 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
VAT1Q99536 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VAT1Q99536 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
VAT1Q99536 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VAT1Q99536 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VAT1Q99536 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VAT1Q99536 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VAT1Q99536 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VAT1Q99536 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VAT1Q99536 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VAT1Q99536 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VAT1Q99536 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VAT1Q99536 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VAT1Q99536 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
VAT1Q99536 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VAT1Q99536 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VAT1Q99536 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VAT1Q99536 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VAT1Q99536 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VAT1Q99536 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VAT1Q99536 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VAT1Q99536 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VAT1Q99536 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VAT1Q99536 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
VAT1Q99536 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
VAT1Q99536 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
VAT1Q99536 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
VAT1Q99536 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VAT1Q99536 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VAT1Q99536 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VAT1Q99536 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VAT1Q99536 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VAT1Q99536 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VAT1Q99536 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
VAT1Q99536 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VAT1Q99536 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VAT1Q99536 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VAT1Q99536 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VAT1Q99536 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VAT1Q99536 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms