Protein–RNA interactions for Protein: Q96QG7

MTMR9, Myotubularin-related protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 549 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR9Q96QG7 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MTMR9Q96QG7 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MTMR9Q96QG7 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MTMR9Q96QG7 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
MTMR9Q96QG7 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MTMR9Q96QG7 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MTMR9Q96QG7 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MTMR9Q96QG7 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MTMR9Q96QG7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MTMR9Q96QG7 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MTMR9Q96QG7 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
MTMR9Q96QG7 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MTMR9Q96QG7 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MTMR9Q96QG7 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MTMR9Q96QG7 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MTMR9Q96QG7 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MTMR9Q96QG7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MTMR9Q96QG7 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MTMR9Q96QG7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MTMR9Q96QG7 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MTMR9Q96QG7 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MTMR9Q96QG7 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MTMR9Q96QG7 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MTMR9Q96QG7 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MTMR9Q96QG7 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MTMR9Q96QG7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MTMR9Q96QG7 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MTMR9Q96QG7 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MTMR9Q96QG7 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MTMR9Q96QG7 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MTMR9Q96QG7 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MTMR9Q96QG7 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
MTMR9Q96QG7 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MTMR9Q96QG7 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MTMR9Q96QG7 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MTMR9Q96QG7 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MTMR9Q96QG7 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MTMR9Q96QG7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MTMR9Q96QG7 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MTMR9Q96QG7 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
MTMR9Q96QG7 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
MTMR9Q96QG7 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MTMR9Q96QG7 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
MTMR9Q96QG7 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MTMR9Q96QG7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MTMR9Q96QG7 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MTMR9Q96QG7 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MTMR9Q96QG7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MTMR9Q96QG7 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MTMR9Q96QG7 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MTMR9Q96QG7 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
MTMR9Q96QG7 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MTMR9Q96QG7 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MTMR9Q96QG7 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MTMR9Q96QG7 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
MTMR9Q96QG7 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
MTMR9Q96QG7 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
MTMR9Q96QG7 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MTMR9Q96QG7 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MTMR9Q96QG7 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MTMR9Q96QG7 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MTMR9Q96QG7 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MTMR9Q96QG7 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MTMR9Q96QG7 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MTMR9Q96QG7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MTMR9Q96QG7 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MTMR9Q96QG7 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MTMR9Q96QG7 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MTMR9Q96QG7 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MTMR9Q96QG7 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MTMR9Q96QG7 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MTMR9Q96QG7 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MTMR9Q96QG7 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MTMR9Q96QG7 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MTMR9Q96QG7 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
MTMR9Q96QG7 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
MTMR9Q96QG7 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MTMR9Q96QG7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MTMR9Q96QG7 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MTMR9Q96QG7 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MTMR9Q96QG7 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MTMR9Q96QG7 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MTMR9Q96QG7 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MTMR9Q96QG7 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MTMR9Q96QG7 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MTMR9Q96QG7 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
MTMR9Q96QG7 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
MTMR9Q96QG7 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
MTMR9Q96QG7 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
MTMR9Q96QG7 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
MTMR9Q96QG7 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26■■□□□ 1.75
MTMR9Q96QG7 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
MTMR9Q96QG7 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MTMR9Q96QG7 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MTMR9Q96QG7 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MTMR9Q96QG7 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MTMR9Q96QG7 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MTMR9Q96QG7 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MTMR9Q96QG7 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MTMR9Q96QG7 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms