Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF7

GCNA, Acidic repeat-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNAQ96QF7 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
GCNAQ96QF7 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GCNAQ96QF7 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GCNAQ96QF7 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GCNAQ96QF7 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GCNAQ96QF7 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GCNAQ96QF7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GCNAQ96QF7 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GCNAQ96QF7 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GCNAQ96QF7 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GCNAQ96QF7 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GCNAQ96QF7 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GCNAQ96QF7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GCNAQ96QF7 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GCNAQ96QF7 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GCNAQ96QF7 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GCNAQ96QF7 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GCNAQ96QF7 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GCNAQ96QF7 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GCNAQ96QF7 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GCNAQ96QF7 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GCNAQ96QF7 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GCNAQ96QF7 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GCNAQ96QF7 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
GCNAQ96QF7 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GCNAQ96QF7 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GCNAQ96QF7 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GCNAQ96QF7 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GCNAQ96QF7 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GCNAQ96QF7 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GCNAQ96QF7 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GCNAQ96QF7 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GCNAQ96QF7 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GCNAQ96QF7 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GCNAQ96QF7 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GCNAQ96QF7 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GCNAQ96QF7 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GCNAQ96QF7 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GCNAQ96QF7 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GCNAQ96QF7 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GCNAQ96QF7 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
GCNAQ96QF7 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GCNAQ96QF7 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GCNAQ96QF7 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GCNAQ96QF7 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GCNAQ96QF7 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GCNAQ96QF7 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GCNAQ96QF7 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GCNAQ96QF7 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
GCNAQ96QF7 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GCNAQ96QF7 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
GCNAQ96QF7 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GCNAQ96QF7 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GCNAQ96QF7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GCNAQ96QF7 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GCNAQ96QF7 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
GCNAQ96QF7 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GCNAQ96QF7 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GCNAQ96QF7 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GCNAQ96QF7 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GCNAQ96QF7 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GCNAQ96QF7 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GCNAQ96QF7 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GCNAQ96QF7 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GCNAQ96QF7 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GCNAQ96QF7 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GCNAQ96QF7 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GCNAQ96QF7 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GCNAQ96QF7 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GCNAQ96QF7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GCNAQ96QF7 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GCNAQ96QF7 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GCNAQ96QF7 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GCNAQ96QF7 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GCNAQ96QF7 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GCNAQ96QF7 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GCNAQ96QF7 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GCNAQ96QF7 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
GCNAQ96QF7 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GCNAQ96QF7 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GCNAQ96QF7 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GCNAQ96QF7 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GCNAQ96QF7 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GCNAQ96QF7 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GCNAQ96QF7 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GCNAQ96QF7 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GCNAQ96QF7 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GCNAQ96QF7 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GCNAQ96QF7 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GCNAQ96QF7 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GCNAQ96QF7 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GCNAQ96QF7 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GCNAQ96QF7 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GCNAQ96QF7 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GCNAQ96QF7 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GCNAQ96QF7 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GCNAQ96QF7 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
GCNAQ96QF7 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
GCNAQ96QF7 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GCNAQ96QF7 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms