Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q42

ALS2, Alsin, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2Q96Q42 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.65
ALS2Q96Q42 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
ALS2Q96Q42 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
ALS2Q96Q42 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
ALS2Q96Q42 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
ALS2Q96Q42 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
ALS2Q96Q42 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
ALS2Q96Q42 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
ALS2Q96Q42 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
ALS2Q96Q42 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
ALS2Q96Q42 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
ALS2Q96Q42 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
ALS2Q96Q42 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
ALS2Q96Q42 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
ALS2Q96Q42 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
ALS2Q96Q42 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
ALS2Q96Q42 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
ALS2Q96Q42 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
ALS2Q96Q42 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
ALS2Q96Q42 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
ALS2Q96Q42 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
ALS2Q96Q42 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
ALS2Q96Q42 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
ALS2Q96Q42 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
ALS2Q96Q42 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
ALS2Q96Q42 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
ALS2Q96Q42 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
ALS2Q96Q42 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
ALS2Q96Q42 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
ALS2Q96Q42 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
ALS2Q96Q42 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
ALS2Q96Q42 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
ALS2Q96Q42 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
ALS2Q96Q42 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
ALS2Q96Q42 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC31.52■■■□□ 2.64
ALS2Q96Q42 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC31.51■■■□□ 2.64
ALS2Q96Q42 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC31.51■■■□□ 2.64
ALS2Q96Q42 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
ALS2Q96Q42 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
ALS2Q96Q42 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
ALS2Q96Q42 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
ALS2Q96Q42 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
ALS2Q96Q42 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
ALS2Q96Q42 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
ALS2Q96Q42 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC31.51■■■□□ 2.63
ALS2Q96Q42 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC31.51■■■□□ 2.63
ALS2Q96Q42 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
ALS2Q96Q42 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
ALS2Q96Q42 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
ALS2Q96Q42 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
ALS2Q96Q42 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
ALS2Q96Q42 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
ALS2Q96Q42 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
ALS2Q96Q42 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
ALS2Q96Q42 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
ALS2Q96Q42 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
ALS2Q96Q42 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
ALS2Q96Q42 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC31.49■■■□□ 2.63
ALS2Q96Q42 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
ALS2Q96Q42 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
ALS2Q96Q42 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
ALS2Q96Q42 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
ALS2Q96Q42 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
ALS2Q96Q42 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
ALS2Q96Q42 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
ALS2Q96Q42 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
ALS2Q96Q42 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
ALS2Q96Q42 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC31.47■■■□□ 2.63
ALS2Q96Q42 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
ALS2Q96Q42 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
ALS2Q96Q42 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
ALS2Q96Q42 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
ALS2Q96Q42 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
ALS2Q96Q42 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC31.46■■■□□ 2.63
ALS2Q96Q42 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
ALS2Q96Q42 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
ALS2Q96Q42 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
ALS2Q96Q42 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
ALS2Q96Q42 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
ALS2Q96Q42 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
ALS2Q96Q42 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC31.45■■■□□ 2.63
ALS2Q96Q42 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
ALS2Q96Q42 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
ALS2Q96Q42 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
ALS2Q96Q42 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
ALS2Q96Q42 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
ALS2Q96Q42 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
ALS2Q96Q42 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC31.44■■■□□ 2.62
ALS2Q96Q42 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
ALS2Q96Q42 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
ALS2Q96Q42 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
ALS2Q96Q42 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
ALS2Q96Q42 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
ALS2Q96Q42 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
ALS2Q96Q42 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
ALS2Q96Q42 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC31.43■■■□□ 2.62
ALS2Q96Q42 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
ALS2Q96Q42 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
ALS2Q96Q42 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
ALS2Q96Q42 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms