Protein–RNA interactions for Protein: Q96NL0

RUNDC3B, RUN domain-containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC3BQ96NL0 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RUNDC3BQ96NL0 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RUNDC3BQ96NL0 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RUNDC3BQ96NL0 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RUNDC3BQ96NL0 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RUNDC3BQ96NL0 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RUNDC3BQ96NL0 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RUNDC3BQ96NL0 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RUNDC3BQ96NL0 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RUNDC3BQ96NL0 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RUNDC3BQ96NL0 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RUNDC3BQ96NL0 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RUNDC3BQ96NL0 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RUNDC3BQ96NL0 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RUNDC3BQ96NL0 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RUNDC3BQ96NL0 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RUNDC3BQ96NL0 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RUNDC3BQ96NL0 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RUNDC3BQ96NL0 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RUNDC3BQ96NL0 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RUNDC3BQ96NL0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RUNDC3BQ96NL0 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RUNDC3BQ96NL0 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RUNDC3BQ96NL0 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RUNDC3BQ96NL0 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RUNDC3BQ96NL0 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RUNDC3BQ96NL0 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RUNDC3BQ96NL0 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RUNDC3BQ96NL0 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RUNDC3BQ96NL0 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RUNDC3BQ96NL0 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RUNDC3BQ96NL0 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RUNDC3BQ96NL0 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RUNDC3BQ96NL0 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RUNDC3BQ96NL0 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RUNDC3BQ96NL0 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RUNDC3BQ96NL0 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RUNDC3BQ96NL0 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RUNDC3BQ96NL0 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RUNDC3BQ96NL0 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RUNDC3BQ96NL0 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RUNDC3BQ96NL0 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RUNDC3BQ96NL0 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RUNDC3BQ96NL0 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RUNDC3BQ96NL0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RUNDC3BQ96NL0 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RUNDC3BQ96NL0 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RUNDC3BQ96NL0 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RUNDC3BQ96NL0 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RUNDC3BQ96NL0 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RUNDC3BQ96NL0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RUNDC3BQ96NL0 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RUNDC3BQ96NL0 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RUNDC3BQ96NL0 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RUNDC3BQ96NL0 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RUNDC3BQ96NL0 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RUNDC3BQ96NL0 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RUNDC3BQ96NL0 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RUNDC3BQ96NL0 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RUNDC3BQ96NL0 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RUNDC3BQ96NL0 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RUNDC3BQ96NL0 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RUNDC3BQ96NL0 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RUNDC3BQ96NL0 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RUNDC3BQ96NL0 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RUNDC3BQ96NL0 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RUNDC3BQ96NL0 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RUNDC3BQ96NL0 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RUNDC3BQ96NL0 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
RUNDC3BQ96NL0 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
RUNDC3BQ96NL0 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RUNDC3BQ96NL0 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RUNDC3BQ96NL0 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RUNDC3BQ96NL0 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RUNDC3BQ96NL0 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RUNDC3BQ96NL0 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RUNDC3BQ96NL0 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RUNDC3BQ96NL0 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RUNDC3BQ96NL0 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RUNDC3BQ96NL0 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RUNDC3BQ96NL0 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RUNDC3BQ96NL0 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RUNDC3BQ96NL0 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
RUNDC3BQ96NL0 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RUNDC3BQ96NL0 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RUNDC3BQ96NL0 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RUNDC3BQ96NL0 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RUNDC3BQ96NL0 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RUNDC3BQ96NL0 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RUNDC3BQ96NL0 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RUNDC3BQ96NL0 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RUNDC3BQ96NL0 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RUNDC3BQ96NL0 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RUNDC3BQ96NL0 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
RUNDC3BQ96NL0 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
RUNDC3BQ96NL0 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RUNDC3BQ96NL0 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RUNDC3BQ96NL0 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RUNDC3BQ96NL0 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RUNDC3BQ96NL0 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms