Protein–RNA interactions for Protein: Q96NA2

RILP, Rab-interacting lysosomal protein, humanhuman

Predictions only

Length 401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RILPQ96NA2 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RILPQ96NA2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RILPQ96NA2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RILPQ96NA2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RILPQ96NA2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RILPQ96NA2 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RILPQ96NA2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RILPQ96NA2 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RILPQ96NA2 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RILPQ96NA2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RILPQ96NA2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RILPQ96NA2 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RILPQ96NA2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RILPQ96NA2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RILPQ96NA2 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RILPQ96NA2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RILPQ96NA2 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RILPQ96NA2 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RILPQ96NA2 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RILPQ96NA2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RILPQ96NA2 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RILPQ96NA2 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RILPQ96NA2 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RILPQ96NA2 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RILPQ96NA2 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RILPQ96NA2 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RILPQ96NA2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RILPQ96NA2 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RILPQ96NA2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RILPQ96NA2 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RILPQ96NA2 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RILPQ96NA2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RILPQ96NA2 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RILPQ96NA2 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RILPQ96NA2 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RILPQ96NA2 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RILPQ96NA2 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
RILPQ96NA2 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
RILPQ96NA2 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RILPQ96NA2 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RILPQ96NA2 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RILPQ96NA2 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RILPQ96NA2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RILPQ96NA2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RILPQ96NA2 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RILPQ96NA2 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RILPQ96NA2 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RILPQ96NA2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RILPQ96NA2 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RILPQ96NA2 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RILPQ96NA2 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RILPQ96NA2 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RILPQ96NA2 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RILPQ96NA2 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RILPQ96NA2 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RILPQ96NA2 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RILPQ96NA2 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RILPQ96NA2 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RILPQ96NA2 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RILPQ96NA2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RILPQ96NA2 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RILPQ96NA2 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RILPQ96NA2 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RILPQ96NA2 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RILPQ96NA2 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RILPQ96NA2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RILPQ96NA2 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RILPQ96NA2 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RILPQ96NA2 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RILPQ96NA2 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RILPQ96NA2 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RILPQ96NA2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RILPQ96NA2 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RILPQ96NA2 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RILPQ96NA2 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RILPQ96NA2 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RILPQ96NA2 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RILPQ96NA2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RILPQ96NA2 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RILPQ96NA2 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RILPQ96NA2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RILPQ96NA2 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RILPQ96NA2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RILPQ96NA2 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RILPQ96NA2 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RILPQ96NA2 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RILPQ96NA2 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RILPQ96NA2 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RILPQ96NA2 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RILPQ96NA2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RILPQ96NA2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RILPQ96NA2 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RILPQ96NA2 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RILPQ96NA2 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RILPQ96NA2 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
RILPQ96NA2 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
RILPQ96NA2 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RILPQ96NA2 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RILPQ96NA2 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RILPQ96NA2 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 393.3 ms