Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG7

NSMCE3, Non-structural maintenance of chromosomes element 3 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE3Q96MG7 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NSMCE3Q96MG7 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NSMCE3Q96MG7 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NSMCE3Q96MG7 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NSMCE3Q96MG7 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NSMCE3Q96MG7 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NSMCE3Q96MG7 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NSMCE3Q96MG7 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NSMCE3Q96MG7 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NSMCE3Q96MG7 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NSMCE3Q96MG7 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NSMCE3Q96MG7 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NSMCE3Q96MG7 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NSMCE3Q96MG7 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NSMCE3Q96MG7 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NSMCE3Q96MG7 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NSMCE3Q96MG7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NSMCE3Q96MG7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NSMCE3Q96MG7 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NSMCE3Q96MG7 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NSMCE3Q96MG7 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NSMCE3Q96MG7 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NSMCE3Q96MG7 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NSMCE3Q96MG7 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NSMCE3Q96MG7 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NSMCE3Q96MG7 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NSMCE3Q96MG7 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NSMCE3Q96MG7 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NSMCE3Q96MG7 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NSMCE3Q96MG7 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NSMCE3Q96MG7 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NSMCE3Q96MG7 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NSMCE3Q96MG7 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NSMCE3Q96MG7 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NSMCE3Q96MG7 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NSMCE3Q96MG7 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NSMCE3Q96MG7 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NSMCE3Q96MG7 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NSMCE3Q96MG7 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NSMCE3Q96MG7 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NSMCE3Q96MG7 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NSMCE3Q96MG7 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NSMCE3Q96MG7 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NSMCE3Q96MG7 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NSMCE3Q96MG7 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NSMCE3Q96MG7 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NSMCE3Q96MG7 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NSMCE3Q96MG7 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NSMCE3Q96MG7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NSMCE3Q96MG7 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NSMCE3Q96MG7 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NSMCE3Q96MG7 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NSMCE3Q96MG7 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NSMCE3Q96MG7 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NSMCE3Q96MG7 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NSMCE3Q96MG7 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NSMCE3Q96MG7 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NSMCE3Q96MG7 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NSMCE3Q96MG7 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NSMCE3Q96MG7 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NSMCE3Q96MG7 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NSMCE3Q96MG7 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NSMCE3Q96MG7 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NSMCE3Q96MG7 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NSMCE3Q96MG7 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NSMCE3Q96MG7 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NSMCE3Q96MG7 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NSMCE3Q96MG7 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NSMCE3Q96MG7 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NSMCE3Q96MG7 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NSMCE3Q96MG7 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NSMCE3Q96MG7 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NSMCE3Q96MG7 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NSMCE3Q96MG7 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NSMCE3Q96MG7 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NSMCE3Q96MG7 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NSMCE3Q96MG7 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NSMCE3Q96MG7 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NSMCE3Q96MG7 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NSMCE3Q96MG7 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NSMCE3Q96MG7 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NSMCE3Q96MG7 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NSMCE3Q96MG7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NSMCE3Q96MG7 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NSMCE3Q96MG7 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NSMCE3Q96MG7 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NSMCE3Q96MG7 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NSMCE3Q96MG7 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NSMCE3Q96MG7 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NSMCE3Q96MG7 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NSMCE3Q96MG7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NSMCE3Q96MG7 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NSMCE3Q96MG7 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
NSMCE3Q96MG7 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
NSMCE3Q96MG7 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NSMCE3Q96MG7 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NSMCE3Q96MG7 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NSMCE3Q96MG7 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NSMCE3Q96MG7 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NSMCE3Q96MG7 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms