Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF0

Putative uncharacterized protein LOC100506887, humanhuman

Predictions only

Length 132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q96MF0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Q96MF0 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Q96MF0 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Q96MF0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q96MF0 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q96MF0 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q96MF0 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q96MF0 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Q96MF0 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q96MF0 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q96MF0 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q96MF0 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q96MF0 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q96MF0 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q96MF0 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q96MF0 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Q96MF0 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q96MF0 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q96MF0 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q96MF0 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q96MF0 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q96MF0 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q96MF0 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q96MF0 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q96MF0 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q96MF0 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q96MF0 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q96MF0 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q96MF0 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Q96MF0 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q96MF0 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q96MF0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q96MF0 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q96MF0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q96MF0 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q96MF0 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q96MF0 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q96MF0 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q96MF0 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q96MF0 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Q96MF0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q96MF0 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q96MF0 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q96MF0 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q96MF0 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q96MF0 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q96MF0 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q96MF0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q96MF0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q96MF0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q96MF0 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q96MF0 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Q96MF0 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Q96MF0 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Q96MF0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Q96MF0 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Q96MF0 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Q96MF0 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Q96MF0 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Q96MF0 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Q96MF0 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Q96MF0 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Q96MF0 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Q96MF0 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Q96MF0 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Q96MF0 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Q96MF0 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Q96MF0 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Q96MF0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q96MF0 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q96MF0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q96MF0 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q96MF0 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q96MF0 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q96MF0 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Q96MF0 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q96MF0 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q96MF0 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q96MF0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q96MF0 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q96MF0 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q96MF0 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q96MF0 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q96MF0 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q96MF0 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q96MF0 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q96MF0 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q96MF0 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q96MF0 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q96MF0 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q96MF0 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q96MF0 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q96MF0 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q96MF0 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q96MF0 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q96MF0 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Q96MF0 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Q96MF0 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q96MF0 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Q96MF0 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms