Protein–RNA interactions for Protein: Q96M60

FAM227B, Protein FAM227B, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM227BQ96M60 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
FAM227BQ96M60 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
FAM227BQ96M60 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
FAM227BQ96M60 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
FAM227BQ96M60 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
FAM227BQ96M60 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
FAM227BQ96M60 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
FAM227BQ96M60 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
FAM227BQ96M60 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
FAM227BQ96M60 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
FAM227BQ96M60 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
FAM227BQ96M60 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
FAM227BQ96M60 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
FAM227BQ96M60 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
FAM227BQ96M60 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
FAM227BQ96M60 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
FAM227BQ96M60 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
FAM227BQ96M60 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
FAM227BQ96M60 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
FAM227BQ96M60 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
FAM227BQ96M60 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
FAM227BQ96M60 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
FAM227BQ96M60 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
FAM227BQ96M60 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
FAM227BQ96M60 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
FAM227BQ96M60 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
FAM227BQ96M60 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
FAM227BQ96M60 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
FAM227BQ96M60 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
FAM227BQ96M60 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
FAM227BQ96M60 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
FAM227BQ96M60 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
FAM227BQ96M60 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
FAM227BQ96M60 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
FAM227BQ96M60 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
FAM227BQ96M60 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
FAM227BQ96M60 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
FAM227BQ96M60 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
FAM227BQ96M60 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
FAM227BQ96M60 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
FAM227BQ96M60 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
FAM227BQ96M60 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
FAM227BQ96M60 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
FAM227BQ96M60 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
FAM227BQ96M60 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
FAM227BQ96M60 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
FAM227BQ96M60 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
FAM227BQ96M60 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
FAM227BQ96M60 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
FAM227BQ96M60 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
FAM227BQ96M60 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
FAM227BQ96M60 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
FAM227BQ96M60 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
FAM227BQ96M60 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
FAM227BQ96M60 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
FAM227BQ96M60 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
FAM227BQ96M60 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
FAM227BQ96M60 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
FAM227BQ96M60 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
FAM227BQ96M60 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
FAM227BQ96M60 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
FAM227BQ96M60 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
FAM227BQ96M60 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
FAM227BQ96M60 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
FAM227BQ96M60 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
FAM227BQ96M60 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
FAM227BQ96M60 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
FAM227BQ96M60 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
FAM227BQ96M60 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
FAM227BQ96M60 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
FAM227BQ96M60 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
FAM227BQ96M60 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
FAM227BQ96M60 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
FAM227BQ96M60 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
FAM227BQ96M60 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
FAM227BQ96M60 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
FAM227BQ96M60 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
FAM227BQ96M60 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
FAM227BQ96M60 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
FAM227BQ96M60 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
FAM227BQ96M60 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
FAM227BQ96M60 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
FAM227BQ96M60 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
FAM227BQ96M60 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
FAM227BQ96M60 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
FAM227BQ96M60 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
FAM227BQ96M60 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
FAM227BQ96M60 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
FAM227BQ96M60 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
FAM227BQ96M60 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
FAM227BQ96M60 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
FAM227BQ96M60 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
FAM227BQ96M60 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
FAM227BQ96M60 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
FAM227BQ96M60 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
FAM227BQ96M60 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
FAM227BQ96M60 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
FAM227BQ96M60 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
FAM227BQ96M60 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
FAM227BQ96M60 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms