Protein–RNA interactions for Protein: Q96LI5

CNOT6L, CCR4-NOT transcription complex subunit 6-like, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT6LQ96LI5 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNOT6LQ96LI5 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CNOT6LQ96LI5 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNOT6LQ96LI5 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNOT6LQ96LI5 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNOT6LQ96LI5 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNOT6LQ96LI5 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNOT6LQ96LI5 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNOT6LQ96LI5 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNOT6LQ96LI5 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNOT6LQ96LI5 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNOT6LQ96LI5 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNOT6LQ96LI5 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNOT6LQ96LI5 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNOT6LQ96LI5 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNOT6LQ96LI5 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNOT6LQ96LI5 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNOT6LQ96LI5 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNOT6LQ96LI5 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNOT6LQ96LI5 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNOT6LQ96LI5 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNOT6LQ96LI5 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNOT6LQ96LI5 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CNOT6LQ96LI5 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNOT6LQ96LI5 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNOT6LQ96LI5 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNOT6LQ96LI5 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNOT6LQ96LI5 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNOT6LQ96LI5 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNOT6LQ96LI5 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNOT6LQ96LI5 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNOT6LQ96LI5 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNOT6LQ96LI5 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNOT6LQ96LI5 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNOT6LQ96LI5 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CNOT6LQ96LI5 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CNOT6LQ96LI5 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CNOT6LQ96LI5 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CNOT6LQ96LI5 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CNOT6LQ96LI5 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CNOT6LQ96LI5 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CNOT6LQ96LI5 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CNOT6LQ96LI5 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNOT6LQ96LI5 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNOT6LQ96LI5 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNOT6LQ96LI5 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNOT6LQ96LI5 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNOT6LQ96LI5 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNOT6LQ96LI5 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNOT6LQ96LI5 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNOT6LQ96LI5 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNOT6LQ96LI5 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNOT6LQ96LI5 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNOT6LQ96LI5 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNOT6LQ96LI5 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNOT6LQ96LI5 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNOT6LQ96LI5 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNOT6LQ96LI5 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNOT6LQ96LI5 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNOT6LQ96LI5 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNOT6LQ96LI5 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNOT6LQ96LI5 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNOT6LQ96LI5 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNOT6LQ96LI5 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNOT6LQ96LI5 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNOT6LQ96LI5 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNOT6LQ96LI5 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNOT6LQ96LI5 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNOT6LQ96LI5 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNOT6LQ96LI5 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNOT6LQ96LI5 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNOT6LQ96LI5 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNOT6LQ96LI5 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNOT6LQ96LI5 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNOT6LQ96LI5 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNOT6LQ96LI5 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNOT6LQ96LI5 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNOT6LQ96LI5 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNOT6LQ96LI5 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNOT6LQ96LI5 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNOT6LQ96LI5 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNOT6LQ96LI5 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNOT6LQ96LI5 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNOT6LQ96LI5 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNOT6LQ96LI5 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CNOT6LQ96LI5 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNOT6LQ96LI5 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNOT6LQ96LI5 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNOT6LQ96LI5 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNOT6LQ96LI5 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNOT6LQ96LI5 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNOT6LQ96LI5 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNOT6LQ96LI5 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNOT6LQ96LI5 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNOT6LQ96LI5 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNOT6LQ96LI5 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNOT6LQ96LI5 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CNOT6LQ96LI5 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNOT6LQ96LI5 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNOT6LQ96LI5 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms