Protein–RNA interactions for Protein: Q96KA5

CLPTM1L, Cleft lip and palate transmembrane protein 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPTM1LQ96KA5 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CLPTM1LQ96KA5 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLPTM1LQ96KA5 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLPTM1LQ96KA5 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLPTM1LQ96KA5 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLPTM1LQ96KA5 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLPTM1LQ96KA5 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLPTM1LQ96KA5 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLPTM1LQ96KA5 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CLPTM1LQ96KA5 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLPTM1LQ96KA5 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLPTM1LQ96KA5 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLPTM1LQ96KA5 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CLPTM1LQ96KA5 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLPTM1LQ96KA5 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLPTM1LQ96KA5 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLPTM1LQ96KA5 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CLPTM1LQ96KA5 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLPTM1LQ96KA5 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLPTM1LQ96KA5 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLPTM1LQ96KA5 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLPTM1LQ96KA5 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLPTM1LQ96KA5 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLPTM1LQ96KA5 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CLPTM1LQ96KA5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLPTM1LQ96KA5 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLPTM1LQ96KA5 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLPTM1LQ96KA5 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLPTM1LQ96KA5 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLPTM1LQ96KA5 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLPTM1LQ96KA5 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLPTM1LQ96KA5 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLPTM1LQ96KA5 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLPTM1LQ96KA5 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLPTM1LQ96KA5 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CLPTM1LQ96KA5 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLPTM1LQ96KA5 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CLPTM1LQ96KA5 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CLPTM1LQ96KA5 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CLPTM1LQ96KA5 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLPTM1LQ96KA5 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLPTM1LQ96KA5 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLPTM1LQ96KA5 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CLPTM1LQ96KA5 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLPTM1LQ96KA5 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLPTM1LQ96KA5 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLPTM1LQ96KA5 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLPTM1LQ96KA5 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLPTM1LQ96KA5 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLPTM1LQ96KA5 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CLPTM1LQ96KA5 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLPTM1LQ96KA5 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLPTM1LQ96KA5 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLPTM1LQ96KA5 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLPTM1LQ96KA5 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLPTM1LQ96KA5 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLPTM1LQ96KA5 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLPTM1LQ96KA5 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLPTM1LQ96KA5 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLPTM1LQ96KA5 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLPTM1LQ96KA5 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLPTM1LQ96KA5 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLPTM1LQ96KA5 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLPTM1LQ96KA5 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLPTM1LQ96KA5 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLPTM1LQ96KA5 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLPTM1LQ96KA5 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLPTM1LQ96KA5 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLPTM1LQ96KA5 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLPTM1LQ96KA5 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLPTM1LQ96KA5 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLPTM1LQ96KA5 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLPTM1LQ96KA5 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CLPTM1LQ96KA5 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CLPTM1LQ96KA5 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CLPTM1LQ96KA5 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLPTM1LQ96KA5 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CLPTM1LQ96KA5 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CLPTM1LQ96KA5 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CLPTM1LQ96KA5 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CLPTM1LQ96KA5 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CLPTM1LQ96KA5 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CLPTM1LQ96KA5 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLPTM1LQ96KA5 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLPTM1LQ96KA5 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLPTM1LQ96KA5 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLPTM1LQ96KA5 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLPTM1LQ96KA5 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLPTM1LQ96KA5 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLPTM1LQ96KA5 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLPTM1LQ96KA5 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLPTM1LQ96KA5 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLPTM1LQ96KA5 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLPTM1LQ96KA5 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLPTM1LQ96KA5 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLPTM1LQ96KA5 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLPTM1LQ96KA5 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLPTM1LQ96KA5 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLPTM1LQ96KA5 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLPTM1LQ96KA5 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms