Protein–RNA interactions for Protein: Q96K76

USP47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, humanhuman

Predictions only

Length 1,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP47Q96K76 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
USP47Q96K76 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC32.58■■■□□ 2.81
USP47Q96K76 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.81
USP47Q96K76 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.81
USP47Q96K76 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
USP47Q96K76 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
USP47Q96K76 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
USP47Q96K76 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
USP47Q96K76 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC32.56■■■□□ 2.8
USP47Q96K76 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
USP47Q96K76 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
USP47Q96K76 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
USP47Q96K76 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
USP47Q96K76 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
USP47Q96K76 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
USP47Q96K76 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
USP47Q96K76 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
USP47Q96K76 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC32.55■■■□□ 2.8
USP47Q96K76 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
USP47Q96K76 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC32.55■■■□□ 2.8
USP47Q96K76 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
USP47Q96K76 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
USP47Q96K76 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
USP47Q96K76 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
USP47Q96K76 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
USP47Q96K76 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
USP47Q96K76 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
USP47Q96K76 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
USP47Q96K76 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
USP47Q96K76 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
USP47Q96K76 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
USP47Q96K76 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
USP47Q96K76 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
USP47Q96K76 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
USP47Q96K76 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
USP47Q96K76 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
USP47Q96K76 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
USP47Q96K76 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
USP47Q96K76 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
USP47Q96K76 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC32.52■■■□□ 2.8
USP47Q96K76 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
USP47Q96K76 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
USP47Q96K76 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
USP47Q96K76 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
USP47Q96K76 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
USP47Q96K76 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
USP47Q96K76 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
USP47Q96K76 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
USP47Q96K76 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
USP47Q96K76 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
USP47Q96K76 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
USP47Q96K76 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
USP47Q96K76 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
USP47Q96K76 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
USP47Q96K76 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
USP47Q96K76 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
USP47Q96K76 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC32.5■■■□□ 2.79
USP47Q96K76 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
USP47Q96K76 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
USP47Q96K76 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
USP47Q96K76 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
USP47Q96K76 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
USP47Q96K76 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
USP47Q96K76 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
USP47Q96K76 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
USP47Q96K76 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
USP47Q96K76 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
USP47Q96K76 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
USP47Q96K76 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
USP47Q96K76 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
USP47Q96K76 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
USP47Q96K76 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
USP47Q96K76 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
USP47Q96K76 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.47■■■□□ 2.79
USP47Q96K76 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
USP47Q96K76 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
USP47Q96K76 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
USP47Q96K76 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
USP47Q96K76 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
USP47Q96K76 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
USP47Q96K76 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
USP47Q96K76 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
USP47Q96K76 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
USP47Q96K76 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
USP47Q96K76 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC32.46■■■□□ 2.79
USP47Q96K76 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
USP47Q96K76 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
USP47Q96K76 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
USP47Q96K76 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
USP47Q96K76 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
USP47Q96K76 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
USP47Q96K76 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
USP47Q96K76 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
USP47Q96K76 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
USP47Q96K76 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
USP47Q96K76 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
USP47Q96K76 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
USP47Q96K76 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.78
USP47Q96K76 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC32.45■■■□□ 2.78
USP47Q96K76 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms