Protein–RNA interactions for Protein: Q96K49

TMEM87B, Transmembrane protein 87B, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM87BQ96K49 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TMEM87BQ96K49 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TMEM87BQ96K49 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TMEM87BQ96K49 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TMEM87BQ96K49 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TMEM87BQ96K49 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TMEM87BQ96K49 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TMEM87BQ96K49 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TMEM87BQ96K49 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TMEM87BQ96K49 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TMEM87BQ96K49 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TMEM87BQ96K49 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TMEM87BQ96K49 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
TMEM87BQ96K49 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TMEM87BQ96K49 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TMEM87BQ96K49 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TMEM87BQ96K49 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TMEM87BQ96K49 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
TMEM87BQ96K49 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TMEM87BQ96K49 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TMEM87BQ96K49 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TMEM87BQ96K49 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TMEM87BQ96K49 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TMEM87BQ96K49 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TMEM87BQ96K49 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
TMEM87BQ96K49 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
TMEM87BQ96K49 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
TMEM87BQ96K49 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TMEM87BQ96K49 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TMEM87BQ96K49 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TMEM87BQ96K49 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TMEM87BQ96K49 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TMEM87BQ96K49 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TMEM87BQ96K49 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TMEM87BQ96K49 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TMEM87BQ96K49 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TMEM87BQ96K49 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TMEM87BQ96K49 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TMEM87BQ96K49 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TMEM87BQ96K49 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TMEM87BQ96K49 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
TMEM87BQ96K49 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TMEM87BQ96K49 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
TMEM87BQ96K49 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
TMEM87BQ96K49 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TMEM87BQ96K49 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TMEM87BQ96K49 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TMEM87BQ96K49 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TMEM87BQ96K49 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TMEM87BQ96K49 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TMEM87BQ96K49 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TMEM87BQ96K49 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TMEM87BQ96K49 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TMEM87BQ96K49 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TMEM87BQ96K49 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TMEM87BQ96K49 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TMEM87BQ96K49 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TMEM87BQ96K49 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
TMEM87BQ96K49 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TMEM87BQ96K49 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TMEM87BQ96K49 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TMEM87BQ96K49 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TMEM87BQ96K49 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TMEM87BQ96K49 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TMEM87BQ96K49 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
TMEM87BQ96K49 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TMEM87BQ96K49 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TMEM87BQ96K49 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TMEM87BQ96K49 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TMEM87BQ96K49 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TMEM87BQ96K49 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TMEM87BQ96K49 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TMEM87BQ96K49 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TMEM87BQ96K49 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TMEM87BQ96K49 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TMEM87BQ96K49 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TMEM87BQ96K49 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
TMEM87BQ96K49 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TMEM87BQ96K49 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TMEM87BQ96K49 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TMEM87BQ96K49 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TMEM87BQ96K49 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TMEM87BQ96K49 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TMEM87BQ96K49 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TMEM87BQ96K49 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TMEM87BQ96K49 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TMEM87BQ96K49 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TMEM87BQ96K49 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TMEM87BQ96K49 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TMEM87BQ96K49 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TMEM87BQ96K49 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TMEM87BQ96K49 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TMEM87BQ96K49 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TMEM87BQ96K49 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TMEM87BQ96K49 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TMEM87BQ96K49 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TMEM87BQ96K49 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TMEM87BQ96K49 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
TMEM87BQ96K49 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TMEM87BQ96K49 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms