Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ5

MS4A4A, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4A, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A4AQ96JQ5 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MS4A4AQ96JQ5 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MS4A4AQ96JQ5 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
MS4A4AQ96JQ5 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
MS4A4AQ96JQ5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MS4A4AQ96JQ5 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MS4A4AQ96JQ5 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MS4A4AQ96JQ5 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MS4A4AQ96JQ5 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MS4A4AQ96JQ5 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
MS4A4AQ96JQ5 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MS4A4AQ96JQ5 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MS4A4AQ96JQ5 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MS4A4AQ96JQ5 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MS4A4AQ96JQ5 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MS4A4AQ96JQ5 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MS4A4AQ96JQ5 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MS4A4AQ96JQ5 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MS4A4AQ96JQ5 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MS4A4AQ96JQ5 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MS4A4AQ96JQ5 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MS4A4AQ96JQ5 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MS4A4AQ96JQ5 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MS4A4AQ96JQ5 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
MS4A4AQ96JQ5 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
MS4A4AQ96JQ5 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
MS4A4AQ96JQ5 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
MS4A4AQ96JQ5 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
MS4A4AQ96JQ5 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MS4A4AQ96JQ5 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
MS4A4AQ96JQ5 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MS4A4AQ96JQ5 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
MS4A4AQ96JQ5 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MS4A4AQ96JQ5 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MS4A4AQ96JQ5 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MS4A4AQ96JQ5 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MS4A4AQ96JQ5 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MS4A4AQ96JQ5 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MS4A4AQ96JQ5 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MS4A4AQ96JQ5 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MS4A4AQ96JQ5 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MS4A4AQ96JQ5 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MS4A4AQ96JQ5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
MS4A4AQ96JQ5 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MS4A4AQ96JQ5 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MS4A4AQ96JQ5 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MS4A4AQ96JQ5 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MS4A4AQ96JQ5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MS4A4AQ96JQ5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MS4A4AQ96JQ5 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MS4A4AQ96JQ5 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MS4A4AQ96JQ5 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MS4A4AQ96JQ5 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MS4A4AQ96JQ5 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MS4A4AQ96JQ5 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
MS4A4AQ96JQ5 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MS4A4AQ96JQ5 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MS4A4AQ96JQ5 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MS4A4AQ96JQ5 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
MS4A4AQ96JQ5 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MS4A4AQ96JQ5 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MS4A4AQ96JQ5 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MS4A4AQ96JQ5 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
MS4A4AQ96JQ5 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MS4A4AQ96JQ5 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
MS4A4AQ96JQ5 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
MS4A4AQ96JQ5 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MS4A4AQ96JQ5 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
MS4A4AQ96JQ5 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MS4A4AQ96JQ5 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
MS4A4AQ96JQ5 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MS4A4AQ96JQ5 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MS4A4AQ96JQ5 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MS4A4AQ96JQ5 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MS4A4AQ96JQ5 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MS4A4AQ96JQ5 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MS4A4AQ96JQ5 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MS4A4AQ96JQ5 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MS4A4AQ96JQ5 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MS4A4AQ96JQ5 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MS4A4AQ96JQ5 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MS4A4AQ96JQ5 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MS4A4AQ96JQ5 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MS4A4AQ96JQ5 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MS4A4AQ96JQ5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MS4A4AQ96JQ5 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MS4A4AQ96JQ5 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MS4A4AQ96JQ5 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MS4A4AQ96JQ5 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MS4A4AQ96JQ5 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MS4A4AQ96JQ5 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MS4A4AQ96JQ5 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MS4A4AQ96JQ5 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MS4A4AQ96JQ5 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MS4A4AQ96JQ5 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MS4A4AQ96JQ5 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MS4A4AQ96JQ5 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MS4A4AQ96JQ5 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
MS4A4AQ96JQ5 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MS4A4AQ96JQ5 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms