Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM3

CHAMP1, Chromosome alignment-maintaining phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAMP1Q96JM3 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CHAMP1Q96JM3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CHAMP1Q96JM3 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CHAMP1Q96JM3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CHAMP1Q96JM3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CHAMP1Q96JM3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CHAMP1Q96JM3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
CHAMP1Q96JM3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CHAMP1Q96JM3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CHAMP1Q96JM3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CHAMP1Q96JM3 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CHAMP1Q96JM3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CHAMP1Q96JM3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CHAMP1Q96JM3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CHAMP1Q96JM3 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CHAMP1Q96JM3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CHAMP1Q96JM3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CHAMP1Q96JM3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CHAMP1Q96JM3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CHAMP1Q96JM3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CHAMP1Q96JM3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CHAMP1Q96JM3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CHAMP1Q96JM3 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CHAMP1Q96JM3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CHAMP1Q96JM3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CHAMP1Q96JM3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CHAMP1Q96JM3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CHAMP1Q96JM3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHAMP1Q96JM3 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHAMP1Q96JM3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHAMP1Q96JM3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHAMP1Q96JM3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHAMP1Q96JM3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHAMP1Q96JM3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CHAMP1Q96JM3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CHAMP1Q96JM3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CHAMP1Q96JM3 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CHAMP1Q96JM3 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CHAMP1Q96JM3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CHAMP1Q96JM3 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CHAMP1Q96JM3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
CHAMP1Q96JM3 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
CHAMP1Q96JM3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CHAMP1Q96JM3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CHAMP1Q96JM3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CHAMP1Q96JM3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CHAMP1Q96JM3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CHAMP1Q96JM3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CHAMP1Q96JM3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CHAMP1Q96JM3 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CHAMP1Q96JM3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CHAMP1Q96JM3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CHAMP1Q96JM3 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CHAMP1Q96JM3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CHAMP1Q96JM3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CHAMP1Q96JM3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CHAMP1Q96JM3 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CHAMP1Q96JM3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CHAMP1Q96JM3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CHAMP1Q96JM3 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CHAMP1Q96JM3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CHAMP1Q96JM3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CHAMP1Q96JM3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CHAMP1Q96JM3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CHAMP1Q96JM3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CHAMP1Q96JM3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CHAMP1Q96JM3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CHAMP1Q96JM3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CHAMP1Q96JM3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CHAMP1Q96JM3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CHAMP1Q96JM3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CHAMP1Q96JM3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CHAMP1Q96JM3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CHAMP1Q96JM3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CHAMP1Q96JM3 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CHAMP1Q96JM3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CHAMP1Q96JM3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CHAMP1Q96JM3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CHAMP1Q96JM3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CHAMP1Q96JM3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CHAMP1Q96JM3 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CHAMP1Q96JM3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CHAMP1Q96JM3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CHAMP1Q96JM3 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CHAMP1Q96JM3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CHAMP1Q96JM3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CHAMP1Q96JM3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CHAMP1Q96JM3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CHAMP1Q96JM3 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CHAMP1Q96JM3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CHAMP1Q96JM3 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CHAMP1Q96JM3 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CHAMP1Q96JM3 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CHAMP1Q96JM3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CHAMP1Q96JM3 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CHAMP1Q96JM3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CHAMP1Q96JM3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CHAMP1Q96JM3 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CHAMP1Q96JM3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CHAMP1Q96JM3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms