Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB3

HIC2, Hypermethylated in cancer 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIC2Q96JB3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
HIC2Q96JB3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HIC2Q96JB3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HIC2Q96JB3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HIC2Q96JB3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HIC2Q96JB3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HIC2Q96JB3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HIC2Q96JB3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HIC2Q96JB3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
HIC2Q96JB3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HIC2Q96JB3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HIC2Q96JB3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HIC2Q96JB3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HIC2Q96JB3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HIC2Q96JB3 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HIC2Q96JB3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HIC2Q96JB3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HIC2Q96JB3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HIC2Q96JB3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HIC2Q96JB3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HIC2Q96JB3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HIC2Q96JB3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HIC2Q96JB3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HIC2Q96JB3 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HIC2Q96JB3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HIC2Q96JB3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HIC2Q96JB3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HIC2Q96JB3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HIC2Q96JB3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HIC2Q96JB3 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HIC2Q96JB3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HIC2Q96JB3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HIC2Q96JB3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
HIC2Q96JB3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HIC2Q96JB3 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HIC2Q96JB3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HIC2Q96JB3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HIC2Q96JB3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HIC2Q96JB3 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HIC2Q96JB3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HIC2Q96JB3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HIC2Q96JB3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
HIC2Q96JB3 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HIC2Q96JB3 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HIC2Q96JB3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HIC2Q96JB3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HIC2Q96JB3 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
HIC2Q96JB3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HIC2Q96JB3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HIC2Q96JB3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HIC2Q96JB3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HIC2Q96JB3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HIC2Q96JB3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HIC2Q96JB3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HIC2Q96JB3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HIC2Q96JB3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HIC2Q96JB3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HIC2Q96JB3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HIC2Q96JB3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HIC2Q96JB3 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HIC2Q96JB3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HIC2Q96JB3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HIC2Q96JB3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HIC2Q96JB3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HIC2Q96JB3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HIC2Q96JB3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HIC2Q96JB3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HIC2Q96JB3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HIC2Q96JB3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HIC2Q96JB3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HIC2Q96JB3 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HIC2Q96JB3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HIC2Q96JB3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HIC2Q96JB3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HIC2Q96JB3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HIC2Q96JB3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HIC2Q96JB3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HIC2Q96JB3 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HIC2Q96JB3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HIC2Q96JB3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
HIC2Q96JB3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HIC2Q96JB3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HIC2Q96JB3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
HIC2Q96JB3 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
HIC2Q96JB3 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HIC2Q96JB3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HIC2Q96JB3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HIC2Q96JB3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HIC2Q96JB3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HIC2Q96JB3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HIC2Q96JB3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HIC2Q96JB3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HIC2Q96JB3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HIC2Q96JB3 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HIC2Q96JB3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HIC2Q96JB3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HIC2Q96JB3 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HIC2Q96JB3 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HIC2Q96JB3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HIC2Q96JB3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms