Protein–RNA interactions for Protein: Q96H20

SNF8, Vacuolar-sorting protein SNF8, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNF8Q96H20 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNF8Q96H20 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNF8Q96H20 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNF8Q96H20 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNF8Q96H20 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNF8Q96H20 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNF8Q96H20 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNF8Q96H20 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNF8Q96H20 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNF8Q96H20 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNF8Q96H20 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNF8Q96H20 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNF8Q96H20 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNF8Q96H20 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNF8Q96H20 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNF8Q96H20 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNF8Q96H20 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNF8Q96H20 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNF8Q96H20 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNF8Q96H20 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNF8Q96H20 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNF8Q96H20 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNF8Q96H20 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNF8Q96H20 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNF8Q96H20 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNF8Q96H20 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNF8Q96H20 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNF8Q96H20 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNF8Q96H20 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNF8Q96H20 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNF8Q96H20 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNF8Q96H20 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNF8Q96H20 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNF8Q96H20 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNF8Q96H20 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNF8Q96H20 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SNF8Q96H20 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SNF8Q96H20 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SNF8Q96H20 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNF8Q96H20 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNF8Q96H20 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNF8Q96H20 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNF8Q96H20 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNF8Q96H20 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNF8Q96H20 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNF8Q96H20 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNF8Q96H20 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNF8Q96H20 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNF8Q96H20 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNF8Q96H20 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNF8Q96H20 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNF8Q96H20 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNF8Q96H20 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNF8Q96H20 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNF8Q96H20 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNF8Q96H20 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNF8Q96H20 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNF8Q96H20 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNF8Q96H20 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNF8Q96H20 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNF8Q96H20 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNF8Q96H20 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNF8Q96H20 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNF8Q96H20 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNF8Q96H20 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNF8Q96H20 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNF8Q96H20 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNF8Q96H20 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNF8Q96H20 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNF8Q96H20 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNF8Q96H20 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNF8Q96H20 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNF8Q96H20 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNF8Q96H20 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNF8Q96H20 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNF8Q96H20 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNF8Q96H20 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNF8Q96H20 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNF8Q96H20 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNF8Q96H20 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNF8Q96H20 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNF8Q96H20 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNF8Q96H20 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNF8Q96H20 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNF8Q96H20 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNF8Q96H20 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNF8Q96H20 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNF8Q96H20 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNF8Q96H20 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNF8Q96H20 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNF8Q96H20 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNF8Q96H20 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SNF8Q96H20 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SNF8Q96H20 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SNF8Q96H20 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SNF8Q96H20 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNF8Q96H20 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNF8Q96H20 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNF8Q96H20 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SNF8Q96H20 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms