Protein–RNA interactions for Protein: Q96GW7

BCAN, Brevican core protein, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCANQ96GW7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
BCANQ96GW7 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
BCANQ96GW7 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
BCANQ96GW7 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC33.59■■■□□ 2.97
BCANQ96GW7 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
BCANQ96GW7 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
BCANQ96GW7 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
BCANQ96GW7 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
BCANQ96GW7 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC33.58■■■□□ 2.97
BCANQ96GW7 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
BCANQ96GW7 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
BCANQ96GW7 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
BCANQ96GW7 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
BCANQ96GW7 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
BCANQ96GW7 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.97
BCANQ96GW7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.97
BCANQ96GW7 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
BCANQ96GW7 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
BCANQ96GW7 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
BCANQ96GW7 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC33.57■■■□□ 2.96
BCANQ96GW7 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
BCANQ96GW7 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
BCANQ96GW7 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
BCANQ96GW7 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
BCANQ96GW7 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC33.55■■■□□ 2.96
BCANQ96GW7 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
BCANQ96GW7 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
BCANQ96GW7 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
BCANQ96GW7 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
BCANQ96GW7 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
BCANQ96GW7 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
BCANQ96GW7 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
BCANQ96GW7 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
BCANQ96GW7 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
BCANQ96GW7 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
BCANQ96GW7 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
BCANQ96GW7 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
BCANQ96GW7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
BCANQ96GW7 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
BCANQ96GW7 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
BCANQ96GW7 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
BCANQ96GW7 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
BCANQ96GW7 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
BCANQ96GW7 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
BCANQ96GW7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
BCANQ96GW7 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
BCANQ96GW7 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
BCANQ96GW7 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
BCANQ96GW7 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
BCANQ96GW7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
BCANQ96GW7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
BCANQ96GW7 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
BCANQ96GW7 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
BCANQ96GW7 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
BCANQ96GW7 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
BCANQ96GW7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
BCANQ96GW7 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
BCANQ96GW7 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC33.49■■■□□ 2.95
BCANQ96GW7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
BCANQ96GW7 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
BCANQ96GW7 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
BCANQ96GW7 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
BCANQ96GW7 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
BCANQ96GW7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
BCANQ96GW7 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
BCANQ96GW7 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
BCANQ96GW7 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
BCANQ96GW7 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC33.47■■■□□ 2.95
BCANQ96GW7 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
BCANQ96GW7 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
BCANQ96GW7 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
BCANQ96GW7 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
BCANQ96GW7 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
BCANQ96GW7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
BCANQ96GW7 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
BCANQ96GW7 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
BCANQ96GW7 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
BCANQ96GW7 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
BCANQ96GW7 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.45■■■□□ 2.94
BCANQ96GW7 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
BCANQ96GW7 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
BCANQ96GW7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
BCANQ96GW7 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
BCANQ96GW7 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
BCANQ96GW7 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
BCANQ96GW7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
BCANQ96GW7 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
BCANQ96GW7 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
BCANQ96GW7 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
BCANQ96GW7 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
BCANQ96GW7 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
BCANQ96GW7 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
BCANQ96GW7 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
BCANQ96GW7 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
BCANQ96GW7 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
BCANQ96GW7 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
BCANQ96GW7 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
BCANQ96GW7 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
BCANQ96GW7 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
BCANQ96GW7 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms