Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP9

SLC10A4, Sodium/bile acid cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A4Q96EP9 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLC10A4Q96EP9 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLC10A4Q96EP9 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLC10A4Q96EP9 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
SLC10A4Q96EP9 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLC10A4Q96EP9 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
SLC10A4Q96EP9 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLC10A4Q96EP9 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLC10A4Q96EP9 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLC10A4Q96EP9 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLC10A4Q96EP9 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLC10A4Q96EP9 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLC10A4Q96EP9 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLC10A4Q96EP9 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLC10A4Q96EP9 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLC10A4Q96EP9 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLC10A4Q96EP9 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLC10A4Q96EP9 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLC10A4Q96EP9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLC10A4Q96EP9 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLC10A4Q96EP9 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SLC10A4Q96EP9 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SLC10A4Q96EP9 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SLC10A4Q96EP9 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SLC10A4Q96EP9 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SLC10A4Q96EP9 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLC10A4Q96EP9 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLC10A4Q96EP9 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLC10A4Q96EP9 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SLC10A4Q96EP9 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SLC10A4Q96EP9 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SLC10A4Q96EP9 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLC10A4Q96EP9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLC10A4Q96EP9 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLC10A4Q96EP9 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLC10A4Q96EP9 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLC10A4Q96EP9 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLC10A4Q96EP9 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLC10A4Q96EP9 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLC10A4Q96EP9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLC10A4Q96EP9 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
SLC10A4Q96EP9 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC10A4Q96EP9 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC10A4Q96EP9 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC10A4Q96EP9 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC10A4Q96EP9 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC10A4Q96EP9 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC10A4Q96EP9 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC10A4Q96EP9 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLC10A4Q96EP9 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLC10A4Q96EP9 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLC10A4Q96EP9 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLC10A4Q96EP9 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLC10A4Q96EP9 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLC10A4Q96EP9 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLC10A4Q96EP9 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLC10A4Q96EP9 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLC10A4Q96EP9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLC10A4Q96EP9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
SLC10A4Q96EP9 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.08■■□□□ 1.92
SLC10A4Q96EP9 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLC10A4Q96EP9 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLC10A4Q96EP9 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLC10A4Q96EP9 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLC10A4Q96EP9 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLC10A4Q96EP9 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLC10A4Q96EP9 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLC10A4Q96EP9 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLC10A4Q96EP9 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLC10A4Q96EP9 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLC10A4Q96EP9 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLC10A4Q96EP9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLC10A4Q96EP9 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLC10A4Q96EP9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLC10A4Q96EP9 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLC10A4Q96EP9 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLC10A4Q96EP9 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SLC10A4Q96EP9 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC10A4Q96EP9 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC10A4Q96EP9 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC10A4Q96EP9 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC10A4Q96EP9 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC10A4Q96EP9 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC10A4Q96EP9 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLC10A4Q96EP9 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLC10A4Q96EP9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLC10A4Q96EP9 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
SLC10A4Q96EP9 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLC10A4Q96EP9 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
SLC10A4Q96EP9 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
SLC10A4Q96EP9 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLC10A4Q96EP9 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC10A4Q96EP9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC10A4Q96EP9 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC10A4Q96EP9 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC10A4Q96EP9 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC10A4Q96EP9 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC10A4Q96EP9 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC10A4Q96EP9 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC10A4Q96EP9 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms