Protein–RNA interactions for Protein: Q96CE8

TM4SF18, Transmembrane 4 L6 family member 18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF18Q96CE8 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TM4SF18Q96CE8 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TM4SF18Q96CE8 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TM4SF18Q96CE8 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TM4SF18Q96CE8 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TM4SF18Q96CE8 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TM4SF18Q96CE8 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TM4SF18Q96CE8 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TM4SF18Q96CE8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TM4SF18Q96CE8 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TM4SF18Q96CE8 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TM4SF18Q96CE8 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TM4SF18Q96CE8 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TM4SF18Q96CE8 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TM4SF18Q96CE8 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TM4SF18Q96CE8 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TM4SF18Q96CE8 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TM4SF18Q96CE8 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TM4SF18Q96CE8 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TM4SF18Q96CE8 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TM4SF18Q96CE8 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TM4SF18Q96CE8 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TM4SF18Q96CE8 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TM4SF18Q96CE8 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TM4SF18Q96CE8 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TM4SF18Q96CE8 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TM4SF18Q96CE8 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TM4SF18Q96CE8 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TM4SF18Q96CE8 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TM4SF18Q96CE8 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TM4SF18Q96CE8 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TM4SF18Q96CE8 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TM4SF18Q96CE8 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TM4SF18Q96CE8 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TM4SF18Q96CE8 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TM4SF18Q96CE8 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TM4SF18Q96CE8 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TM4SF18Q96CE8 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TM4SF18Q96CE8 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TM4SF18Q96CE8 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TM4SF18Q96CE8 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TM4SF18Q96CE8 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TM4SF18Q96CE8 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TM4SF18Q96CE8 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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TM4SF18Q96CE8 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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TM4SF18Q96CE8 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TM4SF18Q96CE8 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TM4SF18Q96CE8 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TM4SF18Q96CE8 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TM4SF18Q96CE8 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TM4SF18Q96CE8 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TM4SF18Q96CE8 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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TM4SF18Q96CE8 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TM4SF18Q96CE8 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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TM4SF18Q96CE8 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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TM4SF18Q96CE8 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TM4SF18Q96CE8 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
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TM4SF18Q96CE8 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TM4SF18Q96CE8 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TM4SF18Q96CE8 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TM4SF18Q96CE8 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TM4SF18Q96CE8 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TM4SF18Q96CE8 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TM4SF18Q96CE8 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TM4SF18Q96CE8 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TM4SF18Q96CE8 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TM4SF18Q96CE8 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TM4SF18Q96CE8 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TM4SF18Q96CE8 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TM4SF18Q96CE8 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TM4SF18Q96CE8 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TM4SF18Q96CE8 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TM4SF18Q96CE8 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TM4SF18Q96CE8 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TM4SF18Q96CE8 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TM4SF18Q96CE8 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TM4SF18Q96CE8 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TM4SF18Q96CE8 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
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