Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ1

FAM3D, Protein FAM3D, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3DQ96BQ1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FAM3DQ96BQ1 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
FAM3DQ96BQ1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
FAM3DQ96BQ1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FAM3DQ96BQ1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
FAM3DQ96BQ1 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FAM3DQ96BQ1 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
FAM3DQ96BQ1 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FAM3DQ96BQ1 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
FAM3DQ96BQ1 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
FAM3DQ96BQ1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
FAM3DQ96BQ1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
FAM3DQ96BQ1 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
FAM3DQ96BQ1 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
FAM3DQ96BQ1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
FAM3DQ96BQ1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
FAM3DQ96BQ1 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
FAM3DQ96BQ1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
FAM3DQ96BQ1 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
FAM3DQ96BQ1 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
FAM3DQ96BQ1 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FAM3DQ96BQ1 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FAM3DQ96BQ1 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FAM3DQ96BQ1 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FAM3DQ96BQ1 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FAM3DQ96BQ1 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
FAM3DQ96BQ1 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FAM3DQ96BQ1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FAM3DQ96BQ1 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FAM3DQ96BQ1 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FAM3DQ96BQ1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FAM3DQ96BQ1 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FAM3DQ96BQ1 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FAM3DQ96BQ1 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FAM3DQ96BQ1 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FAM3DQ96BQ1 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FAM3DQ96BQ1 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FAM3DQ96BQ1 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FAM3DQ96BQ1 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
FAM3DQ96BQ1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FAM3DQ96BQ1 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FAM3DQ96BQ1 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FAM3DQ96BQ1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FAM3DQ96BQ1 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM3DQ96BQ1 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM3DQ96BQ1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM3DQ96BQ1 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM3DQ96BQ1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM3DQ96BQ1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM3DQ96BQ1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM3DQ96BQ1 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM3DQ96BQ1 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM3DQ96BQ1 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM3DQ96BQ1 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM3DQ96BQ1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM3DQ96BQ1 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
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FAM3DQ96BQ1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
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FAM3DQ96BQ1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FAM3DQ96BQ1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FAM3DQ96BQ1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FAM3DQ96BQ1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FAM3DQ96BQ1 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FAM3DQ96BQ1 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FAM3DQ96BQ1 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
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FAM3DQ96BQ1 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
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FAM3DQ96BQ1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FAM3DQ96BQ1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FAM3DQ96BQ1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FAM3DQ96BQ1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FAM3DQ96BQ1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
FAM3DQ96BQ1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
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FAM3DQ96BQ1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
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FAM3DQ96BQ1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FAM3DQ96BQ1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FAM3DQ96BQ1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FAM3DQ96BQ1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FAM3DQ96BQ1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FAM3DQ96BQ1 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
FAM3DQ96BQ1 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
FAM3DQ96BQ1 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
FAM3DQ96BQ1 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
FAM3DQ96BQ1 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FAM3DQ96BQ1 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
FAM3DQ96BQ1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
FAM3DQ96BQ1 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
FAM3DQ96BQ1 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
FAM3DQ96BQ1 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
FAM3DQ96BQ1 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
FAM3DQ96BQ1 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
FAM3DQ96BQ1 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
FAM3DQ96BQ1 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
FAM3DQ96BQ1 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
FAM3DQ96BQ1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
FAM3DQ96BQ1 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
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