Protein–RNA interactions for Protein: Q96A29

SLC35C1, GDP-fucose transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35C1Q96A29 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC35C1Q96A29 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC35C1Q96A29 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC35C1Q96A29 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC35C1Q96A29 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC35C1Q96A29 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC35C1Q96A29 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC35C1Q96A29 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC35C1Q96A29 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC35C1Q96A29 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC35C1Q96A29 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC35C1Q96A29 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC35C1Q96A29 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC35C1Q96A29 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC35C1Q96A29 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC35C1Q96A29 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC35C1Q96A29 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC35C1Q96A29 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC35C1Q96A29 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC35C1Q96A29 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC35C1Q96A29 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC35C1Q96A29 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC35C1Q96A29 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC35C1Q96A29 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC35C1Q96A29 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC35C1Q96A29 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC35C1Q96A29 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC35C1Q96A29 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC35C1Q96A29 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC35C1Q96A29 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC35C1Q96A29 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC35C1Q96A29 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC35C1Q96A29 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC35C1Q96A29 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC35C1Q96A29 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC35C1Q96A29 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC35C1Q96A29 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC35C1Q96A29 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC35C1Q96A29 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC35C1Q96A29 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC35C1Q96A29 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC35C1Q96A29 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SLC35C1Q96A29 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC35C1Q96A29 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC35C1Q96A29 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC35C1Q96A29 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC35C1Q96A29 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC35C1Q96A29 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC35C1Q96A29 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC35C1Q96A29 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC35C1Q96A29 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC35C1Q96A29 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC35C1Q96A29 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC35C1Q96A29 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC35C1Q96A29 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC35C1Q96A29 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC35C1Q96A29 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC35C1Q96A29 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC35C1Q96A29 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC35C1Q96A29 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC35C1Q96A29 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC35C1Q96A29 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC35C1Q96A29 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC35C1Q96A29 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC35C1Q96A29 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC35C1Q96A29 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC35C1Q96A29 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC35C1Q96A29 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC35C1Q96A29 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC35C1Q96A29 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC35C1Q96A29 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC35C1Q96A29 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC35C1Q96A29 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC35C1Q96A29 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC35C1Q96A29 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC35C1Q96A29 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC35C1Q96A29 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC35C1Q96A29 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC35C1Q96A29 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC35C1Q96A29 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC35C1Q96A29 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC35C1Q96A29 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC35C1Q96A29 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC35C1Q96A29 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC35C1Q96A29 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC35C1Q96A29 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC35C1Q96A29 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC35C1Q96A29 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC35C1Q96A29 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC35C1Q96A29 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC35C1Q96A29 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC35C1Q96A29 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC35C1Q96A29 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC35C1Q96A29 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC35C1Q96A29 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC35C1Q96A29 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC35C1Q96A29 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC35C1Q96A29 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC35C1Q96A29 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC35C1Q96A29 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms