Protein–RNA interactions for Protein: Q93084

ATP2A3, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A3Q93084 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP2A3Q93084 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP2A3Q93084 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP2A3Q93084 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP2A3Q93084 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP2A3Q93084 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP2A3Q93084 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP2A3Q93084 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP2A3Q93084 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP2A3Q93084 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP2A3Q93084 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP2A3Q93084 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP2A3Q93084 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP2A3Q93084 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP2A3Q93084 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP2A3Q93084 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP2A3Q93084 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP2A3Q93084 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ATP2A3Q93084 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP2A3Q93084 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP2A3Q93084 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP2A3Q93084 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP2A3Q93084 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP2A3Q93084 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP2A3Q93084 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP2A3Q93084 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP2A3Q93084 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP2A3Q93084 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP2A3Q93084 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP2A3Q93084 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP2A3Q93084 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP2A3Q93084 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP2A3Q93084 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP2A3Q93084 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP2A3Q93084 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP2A3Q93084 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP2A3Q93084 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP2A3Q93084 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP2A3Q93084 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP2A3Q93084 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP2A3Q93084 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP2A3Q93084 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP2A3Q93084 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP2A3Q93084 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP2A3Q93084 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP2A3Q93084 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP2A3Q93084 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP2A3Q93084 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP2A3Q93084 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP2A3Q93084 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP2A3Q93084 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP2A3Q93084 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP2A3Q93084 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP2A3Q93084 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP2A3Q93084 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP2A3Q93084 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP2A3Q93084 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP2A3Q93084 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP2A3Q93084 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP2A3Q93084 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP2A3Q93084 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ATP2A3Q93084 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ATP2A3Q93084 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ATP2A3Q93084 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ATP2A3Q93084 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ATP2A3Q93084 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATP2A3Q93084 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATP2A3Q93084 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATP2A3Q93084 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATP2A3Q93084 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATP2A3Q93084 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP2A3Q93084 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP2A3Q93084 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP2A3Q93084 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP2A3Q93084 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP2A3Q93084 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP2A3Q93084 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP2A3Q93084 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP2A3Q93084 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP2A3Q93084 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP2A3Q93084 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP2A3Q93084 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP2A3Q93084 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP2A3Q93084 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP2A3Q93084 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP2A3Q93084 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP2A3Q93084 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP2A3Q93084 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP2A3Q93084 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP2A3Q93084 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP2A3Q93084 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP2A3Q93084 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP2A3Q93084 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP2A3Q93084 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP2A3Q93084 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP2A3Q93084 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP2A3Q93084 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP2A3Q93084 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP2A3Q93084 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP2A3Q93084 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms