Protein–RNA interactions for Protein: Q92753

RORB, Nuclear receptor ROR-beta, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RORBQ92753 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RORBQ92753 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RORBQ92753 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RORBQ92753 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RORBQ92753 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RORBQ92753 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RORBQ92753 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RORBQ92753 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RORBQ92753 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RORBQ92753 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RORBQ92753 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RORBQ92753 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RORBQ92753 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RORBQ92753 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RORBQ92753 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RORBQ92753 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RORBQ92753 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RORBQ92753 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RORBQ92753 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RORBQ92753 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RORBQ92753 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RORBQ92753 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RORBQ92753 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RORBQ92753 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
RORBQ92753 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RORBQ92753 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RORBQ92753 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RORBQ92753 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RORBQ92753 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RORBQ92753 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RORBQ92753 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RORBQ92753 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RORBQ92753 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RORBQ92753 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RORBQ92753 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RORBQ92753 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RORBQ92753 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RORBQ92753 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RORBQ92753 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RORBQ92753 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RORBQ92753 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RORBQ92753 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RORBQ92753 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RORBQ92753 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RORBQ92753 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
RORBQ92753 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RORBQ92753 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RORBQ92753 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RORBQ92753 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RORBQ92753 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RORBQ92753 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RORBQ92753 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RORBQ92753 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RORBQ92753 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RORBQ92753 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RORBQ92753 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RORBQ92753 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RORBQ92753 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RORBQ92753 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RORBQ92753 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RORBQ92753 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RORBQ92753 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RORBQ92753 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RORBQ92753 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RORBQ92753 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RORBQ92753 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RORBQ92753 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RORBQ92753 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RORBQ92753 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RORBQ92753 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RORBQ92753 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RORBQ92753 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RORBQ92753 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RORBQ92753 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RORBQ92753 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RORBQ92753 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RORBQ92753 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RORBQ92753 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RORBQ92753 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RORBQ92753 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RORBQ92753 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RORBQ92753 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RORBQ92753 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RORBQ92753 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RORBQ92753 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RORBQ92753 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
RORBQ92753 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RORBQ92753 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RORBQ92753 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RORBQ92753 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RORBQ92753 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RORBQ92753 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RORBQ92753 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RORBQ92753 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
RORBQ92753 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RORBQ92753 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RORBQ92753 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RORBQ92753 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RORBQ92753 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
RORBQ92753 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms