Protein–RNA interactions for Protein: Q92729

PTPRU, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, humanhuman

Predictions only

Length 1,446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRUQ92729 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
PTPRUQ92729 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
PTPRUQ92729 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
PTPRUQ92729 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
PTPRUQ92729 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
PTPRUQ92729 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
PTPRUQ92729 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
PTPRUQ92729 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
PTPRUQ92729 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
PTPRUQ92729 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
PTPRUQ92729 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
PTPRUQ92729 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
PTPRUQ92729 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
PTPRUQ92729 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
PTPRUQ92729 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
PTPRUQ92729 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
PTPRUQ92729 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
PTPRUQ92729 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
PTPRUQ92729 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
PTPRUQ92729 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
PTPRUQ92729 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC32.76■■■□□ 2.83
PTPRUQ92729 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
PTPRUQ92729 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC32.76■■■□□ 2.83
PTPRUQ92729 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
PTPRUQ92729 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
PTPRUQ92729 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
PTPRUQ92729 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
PTPRUQ92729 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
PTPRUQ92729 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
PTPRUQ92729 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
PTPRUQ92729 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
PTPRUQ92729 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
PTPRUQ92729 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
PTPRUQ92729 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
PTPRUQ92729 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
PTPRUQ92729 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
PTPRUQ92729 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC32.73■■■□□ 2.83
PTPRUQ92729 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
PTPRUQ92729 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
PTPRUQ92729 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
PTPRUQ92729 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
PTPRUQ92729 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
PTPRUQ92729 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
PTPRUQ92729 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
PTPRUQ92729 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
PTPRUQ92729 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
PTPRUQ92729 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
PTPRUQ92729 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
PTPRUQ92729 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
PTPRUQ92729 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
PTPRUQ92729 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC32.7■■■□□ 2.83
PTPRUQ92729 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
PTPRUQ92729 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
PTPRUQ92729 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
PTPRUQ92729 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC32.69■■■□□ 2.82
PTPRUQ92729 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
PTPRUQ92729 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
PTPRUQ92729 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
PTPRUQ92729 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
PTPRUQ92729 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
PTPRUQ92729 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
PTPRUQ92729 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
PTPRUQ92729 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
PTPRUQ92729 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
PTPRUQ92729 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
PTPRUQ92729 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
PTPRUQ92729 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
PTPRUQ92729 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
PTPRUQ92729 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
PTPRUQ92729 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
PTPRUQ92729 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
PTPRUQ92729 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
PTPRUQ92729 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
PTPRUQ92729 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC32.67■■■□□ 2.82
PTPRUQ92729 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
PTPRUQ92729 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
PTPRUQ92729 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
PTPRUQ92729 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
PTPRUQ92729 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
PTPRUQ92729 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
PTPRUQ92729 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
PTPRUQ92729 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
PTPRUQ92729 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
PTPRUQ92729 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
PTPRUQ92729 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
PTPRUQ92729 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
PTPRUQ92729 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
PTPRUQ92729 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
PTPRUQ92729 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
PTPRUQ92729 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
PTPRUQ92729 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
PTPRUQ92729 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
PTPRUQ92729 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
PTPRUQ92729 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
PTPRUQ92729 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
PTPRUQ92729 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
PTPRUQ92729 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC32.63■■■□□ 2.81
PTPRUQ92729 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
PTPRUQ92729 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
PTPRUQ92729 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms